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十年磨练

木虫 (正式写手)

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[求助] 如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键已有2人参与

如题如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键

大家好，最近我在用gaussian软件计算分子间的相互作用，但是对于操作步骤现在还是不太确定是不是正确的，所以向各位大牛详细请教一下。
现在我把我的计算步骤详细说一下
1）比如两个分子，分别称为分子A和分子B，两个分子之间会形成氢键作用
2）我用gaussian软件用B3LYP/6-311+G*基组分别计算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同时存在两个分子（即分子A和分子B）的能量E(AB) 3）最后计算认为E(AB)-E(A)-E(B)的绝对值是分子间的弱相互作用，
这样的计算方法对不对，还是说要加上BSSE修正E(BSSE)就行了即|E(AB)-E(A)-E(B)|+E(BSSE)

请大家不吝赐教，在此谢谢大家了

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时刻保持虚心学习的态度

1楼 2015-06-22 16:33:19

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引用回帖:

3楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-06-23 10:23:29
B3LYP算氢键并不那么合用（参见“乱谈DFT-D”：http://sobereva.com/83），如果起点不高，计算结果很难说。
不知分子体系有多大。最起码要用b97d。最好用DFT-D。如果氢键体系较小，可以用mp4(sdtq)或者CCSD。...

你好，我能问一下，当进行gaussian计算时，若要想添加色散校正，比方说用M06-2X-D3/6-311+G**方法基组时，在输入文件中该怎么写？
再此谢谢你了