| 查看: 3751 | 回复: 13 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
十年磨练木虫 (正式写手)
|
[求助]
如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键已有2人参与
|
|
|
如题 如何计算分子间的弱相互作用以及分析氢键 大家好，最近我在用gaussian软件计算分子间的相互作用，但是对于操作步骤现在还是不太确定是不是正确的，所以向各位大牛详细请教一下。 现在我把我的计算步骤详细说一下 1）比如两个分子，分别称为分子A和分子B，两个分子之间会形成氢键作用 2）我用gaussian软件用B3LYP/6-311+G*基组分别计算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同时存在两个分子（即分子A和分子B）的能量E(AB) 3）最后计算 认为E(AB)-E(A)-E(B)的绝对值是分子间的弱相互作用， 这样的计算方法对不对，还是说要加上BSSE修正E(BSSE)就行了 即|E(AB)-E(A)-E(B)|+E(BSSE) 请大家不吝赐教，在此谢谢大家了 |
回复此楼» 猜你喜欢
085404（计算机技术）293分 希望调剂到材料相关专业
已经有0人回复
-
大湾区大学（筹）刘天辉课题组招收博士生（与中山大学物理学院联合培养）
已经有16人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有145人回复
-
PbS量子点如何确定浓度
已经有11人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
大湾区大学刘天辉课题组招收2026级博士生（与中山大学物理学院联合培养）
已经有22人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
PbS量子点紫外吸收
已经有0人回复
-
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
809011916
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 316.4
- 帖子: 55
- 在线: 42.3小时
- 虫号: 1501800
- 注册: 2011-11-20
- 性别: GG
- 专业: 化工热力学和基础数据
12楼2015-07-24 15:07:59
kong890109
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 976.4
- 红花: 10
- 帖子: 139
- 在线: 133.6小时
- 虫号: 2382781
- 注册: 2013-03-28
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
★ ★
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-06-24 17:09:32
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-06-24 17:09:32
| 需要BSSE校正，具体的弱相互作用分析方法可以参看此贴http://muchong.com/html/201408/7827455.html；使用过这里面的RDG方法，感觉挺形象的，你可以试试。 |
2楼2015-06-22 20:06:50
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42652.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
十年磨练: 金币+5, ★有帮助 2015-11-03 09:32:15
感谢参与，应助指数 +1
十年磨练: 金币+5, ★有帮助 2015-11-03 09:32:15
|
B3LYP算氢键并不那么合用（参见“乱谈DFT-D”：http://sobereva.com/83），如果起点不高，计算结果很难说。 不知分子体系有多大。最起码要用b97d。最好用DFT-D。如果氢键体系较小，可以用mp4(sdtq)或者CCSD。 |
3楼2015-06-23 10:23:29
十年磨练
木虫 (正式写手)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 6030.2
- 散金: 20
- 红花: 28
- 帖子: 711
- 在线: 444.9小时
- 虫号: 1428184
- 注册: 2011-10-05
- 性别: MM
- 专业: 原子和分子物理
4楼2015-06-23 10:36:26