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cgzhang_gg铜虫 (著名写手)
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[求助]
群里有没有用lammps做加速分子动力学方法模拟的，讨论一下！
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| 如题，目前我看lammps说明书里面有两种加速分子动力学方法，一种是prd，parallel replica dynamics method，另一种是tad，温度加速分子动力学方法，temperature accelerated dynamics。现在我想试着用这两种方法做一下模拟，不知道群里有没有用过这两个命令做过模拟？我想对这些模拟方法做一些改进工作，这就需要了解lammps软件里面的构造（类，类之间的联系），这是一个复杂的工程。群里面有没有对lammps程序结构感兴趣的虫子，可以一起学习lammps程序结构。 |
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cgzhang_gg
铜虫 (著名写手)
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送红花一朵 3楼2015-06-07 09:53:48
lsloneil
专家顾问 (正式写手)
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cgzhang_gg(abinitio代发): 金币+10, 鼓励交流. 正解 2015-06-07 10:27:32
cgzhang_gg(abinitio代发): 金币+10, 鼓励交流. 正解 2015-06-07 10:27:32
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这里基本没人自己改lammps代码，所以在这里求助不会有太大帮助。 如果想改lammps代码，先看developer guide大致了解代码结构。 http://lammps.sandia.gov/doc/Developer.pdf 总之lammps代码结构不难理解，像fix和pair_style都比较容易改，照葫芦画瓢就差不多了,tad什么的可能会难一些。看不懂的代码或者修改代码出错可以直接去lammps mailing list问，那里改代码的人比较多，更熟悉代码的结构。 |
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2楼2015-06-06 22:53:07
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