| 查看: 2033 | 回复: 4 | ||||
cgzhang_gg铜虫 (著名写手)
|
[求助]
群里有没有用lammps做加速分子动力学方法模拟的，讨论一下！
|
| 如题，目前我看lammps说明书里面有两种加速分子动力学方法，一种是prd，parallel replica dynamics method，另一种是tad，温度加速分子动力学方法，temperature accelerated dynamics。现在我想试着用这两种方法做一下模拟，不知道群里有没有用过这两个命令做过模拟？我想对这些模拟方法做一些改进工作，这就需要了解lammps软件里面的构造（类，类之间的联系），这是一个复杂的工程。群里面有没有对lammps程序结构感兴趣的虫子，可以一起学习lammps程序结构。 |
回复此楼» 猜你喜欢
求个博导看看
已经有12人回复
-
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有5人回复
-
求助院士们，这个如何合成呀
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
想换工作。大多数高校都是 评职称时 认可5年内在原单位取得的成果吗？
已经有7人回复
-
需要合成515-64-0，50g，能接单的留言
已经有4人回复
-
自荐读博
已经有4人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Lammps计算油水界面，油相密度、平衡等问题求指导
已经有6人回复
- lammps做拉伸试验，求大神进来指导下（烈日炎炎，有劳了`(*∩_∩*)′）
已经有14人回复
- 最近在学习分子动力学模拟，不知道castep跑分子动力学效果如何呢？
已经有12人回复
- lammps 中 做拉伸时 sss和ssp边界条件不同，结果为什么不一样？？？？
已经有5人回复
- lammps能量最小化，其方法？适用场合？
已经有7人回复
- 经过MS模型导入到LAMMPS，在运算时出现的错误求助
已经有22人回复
- 想做粒子和固体（金属）相互作用，不知道lammps能否实现？
已经有6人回复
- LAMMPS----compute coord/atom命令
已经有11人回复
- ms导出lammps的data文件的亲身经验，希望能帮上各位一点
已经有306人回复
- LAMMPS计算无反应，nan
已经有4人回复
- lammps read_data 文件格式
已经有12人回复
- 【求助】lammps安装过程中，在安装fftw的过程中遇到问题
已经有8人回复
- 【分享】尝试lammps中, 分享中...
已经有15人回复
- 【讨论】编译lammps时Makefile的修改问题
已经有8人回复
lsloneil
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +49 - 模拟EPI: 2
- 应助: 148 (高中生)
- 金币: 8640.9
- 散金: 507
- 红花: 30
- 帖子: 505
- 在线: 598.4小时
- 虫号: 556471
- 注册: 2008-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cgzhang_gg(abinitio代发): 金币+10, 鼓励交流. 正解 2015-06-07 10:27:32
cgzhang_gg(abinitio代发): 金币+10, 鼓励交流. 正解 2015-06-07 10:27:32
|
这里基本没人自己改lammps代码，所以在这里求助不会有太大帮助。 如果想改lammps代码，先看developer guide大致了解代码结构。 http://lammps.sandia.gov/doc/Developer.pdf 总之lammps代码结构不难理解，像fix和pair_style都比较容易改，照葫芦画瓢就差不多了,tad什么的可能会难一些。看不懂的代码或者修改代码出错可以直接去lammps mailing list问，那里改代码的人比较多，更熟悉代码的结构。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
cgzhang_gg2楼2015-06-06 22:53:07
cgzhang_gg
铜虫 (著名写手)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 18.2
- 散金: 790
- 红花: 5
- 帖子: 1095
- 在线: 479.1小时
- 虫号: 1521579
- 注册: 2011-12-03
- 专业: 极端条件下使用的金属材料
3楼2015-06-07 09:53:48
 |
4楼2015-06-07 10:44:20
5楼2015-06-08 09:53:44