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wyqzl

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA,mRNA,CDS,ORF,cDNA,gene的关系是什么已有6人参与

求大神指导啊,最近在学习生物信息学,然后在网上下载序列的时候发现有的是mRNA,有的是CDS,有的是cDNA,后来又遇到ORF,gene这几个东西,实在没搞清楚,这几者之间的关系是什么,他们分别指什么?然后想问问genomic sequence又是啥东西

DNA,mRNA,CDS,ORF,cDNA,gene的关系是什么
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DNA,mRNA,CDS,ORF,cDNA,gene的关系是什么-1
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wyqzl: 金币+8, ★★★很有帮助 2015-06-17 10:06:26
没有做不到,只有想不到!
15楼2015-06-09 18:30:04
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halfbeer

捐助贵宾 (小有名气)

这是啥?

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
wyqzl: 金币+4, ★★★很有帮助 2015-07-09 08:43:23
声明:这个是我从另一个帖子找来的,不是我的,我看着各位回复的揪心。。。。
genome:一个物种的全部遗传物质,真核生物包括核基因和质基因;
gene:按最新的分子生物学解释,包括表达这个基因产物的全部DNA序列,包括ORF序列,内含子外显子,启动子,3'UTR,5'UTR,以及调控区;
ORF:在mRNA上从起始密码子到终止密码子之间的一段序列,该段序列可能编码蛋白质,也可能不编码;
CDS:能翻译成氨基酸序列的DNA序列,从起始密码子到终止密码子,也就是说CDS与所翻译的氨基酸序列存在严格的3对1的关系;
mRNA:基因转录后加工成熟用于翻译蛋白质的序列,包括ORF(此时ORF与CDS相同)序列,3'UTR,5'UTR,5'帽子及3'Poly (A)尾;
hnRNA:核不均一RNA,是指转录获得的最原始序列,没有经过任何加工,序列包含从转录起始位点到转录终止位点的全部序列;
cDNA:通过mRNA反转录所得,与mRNA序列互补的单链DNA或者与mRNA对应的DNA双链;
EST:表达序列标签,是指从一个随机选择的cDNA 克隆,进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp。由于cDNA文库的复杂性和测序的随机性,有时多个EST代表同一基因或基因组,将其归类形成EST簇(EST cluster);
几者关系:
1、DNA就是表示一段脱氧核糖核酸序列;
2、包含关系:gene ∈ genome;EST ∈ cDNA;CDS ∈ ORF;mRNA ∈ hnRNA
说明:基因组上包含若干基因,不多说;一段mRNA上可能包含很多个ORF(只要是以起始密码子开始,终止密码子结束),但是只有能翻译成蛋白质的ORF才能称之为CDS;EST序列是在随机测序过程中获得的cDNA序列的一部分;hnRNA需要经过加工,生成成熟的功能RNA,一条hnRNA可能加工成多条mRNA,也有可能不加工成mRNA而是其他功能RNA,如rRNA,tRNA,核酶等;
3、映射关系:mRNA & cDNA
mRNA与cDNA单链互补,且A与U互补
现在我们能做的就是努力努力再努力
16楼2015-06-10 09:03:39
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普通回帖

bryantchow

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nono2009: 金币-10, 应助指数-1, 屏蔽内容, 违规存档, 严禁回帖广告 2015-06-08 13:44:48
本帖内容被屏蔽

2楼2015-06-04 20:21:38
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顶一下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2015-06-05 07:33:12
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wyqzl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bryantchow at 2015-06-04 20:21:38
楼主,您好,你也可以在这里发布你的问题,有专家在线回答的,反正我问问题,哪里能找到人回答就去哪里发,基本上都去。除了上小木虫,丁香园,等。还是智因 www.biosns.com ,希望能帮到你咯。

网页打不开
4楼2015-06-05 09:15:07
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wyqzl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 刘学欢 at 2015-06-05 07:33:12
顶一下

顶起来啊
5楼2015-06-05 09:15:26
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bryantchow

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

6楼2015-06-06 09:59:48
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yangjingjing

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wyqzl: 金币+2, 有帮助 2015-06-09 16:04:08
CDS是你要的,关键要看清CDS里引号中的基因名称是不是你要的
努力打败一切
7楼2015-06-08 09:52:39
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Cindycclove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


wyqzl: 金币+1, 有帮助 2015-06-09 16:04:23
我的理解是mRNA是没有内含子的DNA,CDS是编码区。
8楼2015-06-08 09:59:23
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cdde1234

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

dna包括内含子和外显子,cDNA就是全是外显子,mRNA就是cDNA转录的RNA序列(但是其实是由mRNA再得出cDNA序列)。CDS就是mRNA翻译出来的氨基酸序列
9楼2015-06-08 11:12:25
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佳璇sxj

木虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by cdde1234 at 2015-06-08 11:12:25
dna包括内含子和外显子,cDNA就是全是外显子,mRNA就是cDNA转录的RNA序列(但是其实是由mRNA再得出cDNA序列)。CDS就是mRNA翻译出来的氨基酸序列

CDS怎么成了氨基酸序列了呢??
10楼2015-06-08 15:46:15
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