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Win7 64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算20150602（原创）
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见附件。 自己总结的Win7 64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算的方法。 对老鸟没啥用。对新手还有一定借鉴意义的。 有不合适的地方欢迎指正！！！我把文字贴出来，要看图片的直接下载附件！ Win7 64位下安装Lammps和MPICH实现单机并行计算20150602（龙门镖局） 让学生搞了半年Lammps，居然说win7 64位不能安装。现在有时间，索性自己来搞定。经过一天的努力，终于实现win7 64位下使用Lammps，并实现MPICH单机下的并行计算。注意：不使用任何虚拟机。 一、 Lammpus软件下载和安装 进入Lammpus官方网站下载：http://lammps.sandia.gov/download.html 直接点击倒数第二个链接“windows installer package”下载安装包。 点击页面下方，“Latest version for 64-bit Windows”下载最新的版本。下载后大约48.6M，点击安装包，安装。 二、 Lammpus软件测试 安装完后到安装目录下，能找到一个bin文件夹。Lammps的可执行文件就在这个文件夹下。 对于初学者，我们一般只调用两个exe文件，一个是lmp_serial.exe，这个文件适用于非并行计算的。另一个是lmp_mpi.exe，这个在MPICH配合下可以实现单机多线程计算和多机分布式计算。 先用lmp_serial.exe来测试安装的程序是否可用。我用example/crack/in.crack文件来测试。lammps的输入文件都命名为in.xxx。 打开windows命令窗口，可以在windos开始菜单中的运行窗口输入cmd打开。 然后在cmd窗口用cd命令（cd命令是dos命令）进入lammps的bin文件夹。在cmd窗口中输入lmp_serial –in in.crack回车，开始计算。 计算完的窗口如下图所示。 说明安装是没问题的。计算时间是15s，用了4个线程。不知道这里4个线程指的啥。我是I5的cpu，计算时看cpu使用不到50%。根据http://rpm.lammps.org/windows.html的提示可以在命令行通过set OMP_NUM_THREADS=n（这里n表示线程数）来设置多线程运算。但是经过试验，不论n=1，4，还是8，计算时间都等于15s。 三、 下载MPICH MPICH软件可以到网关下载：http://www.mpich.org/。但是要注意，MPICH其实即包含了用于并行计算编程的sdk资源，也包含了可行文件。我们这里只用到MPICH的可执行文件。打开http://www.mpich.org/后最新版本的都是用于编程的sdk资源。这目前对我们来说没有用，我们要找可执行文件。 因此我们在页面中找“Older releases are available here”.点击这个here下载之前的版本。点击here后进入http://www.mpich.org/static/downloads/页面。 截至到发稿时间，只有1.4版本的提供windows 64位的MPICH可执行文件。下载mpich2-1.4-win-x86-64.msi并安装。安装成功后进入下一步。 四、 配置MPICH并运行 安装成功后，在MPICH2\bin文件夹下可以找到smpd.exe和mpiexec.exe连个文件。为了方便后面使用，把这两个文件拷贝到lammps的bin文件夹下。 先右键点击smpd.exe，点击属性，设置为管理员权限。然后在cmd窗口中输入smpd –install。安装MPICH2服务。如果没有安装成功，后面运行mpiexec的时候会出现“由于服务器的积极拒绝”之类的错误。有的帖子说要运行smpd -install -phrase beHappy来注册，不知道和smpd –install命令是否等价。总之两个命令我都运行了。最关键的步骤就是要把smpd的属性设定为管理员权限。 然后在win7控制面板里创建一个MPI的管理员帐户，密码也设定为MPI。 运行mpiexec.exe –register注册账户。这里的账户名称和密码就是刚才创建的，都是MPI。 然后在cmd窗口输入mpiexec -n 2 lmp_mpi -in in.crack命令。一会功夫就计算出来了，系统提示耗时10s。证明并行起了成效。 |
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2015-06-03 07:14:40, 477.97 K
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需要这么麻烦吗 我是直接安装完mpich后把mpiexec拷贝到lammps下的bin里就可以用了 只是他提示openmpi environment variable is not set之类的 但是不影响并行计算 而且不需要设置什么mpi管理员密码啥的 发自小木虫IOS客户端 |
49楼2015-10-24 23:48:26
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2015-06-03 23:19
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yujingui7楼
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