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lammps碳纳米管拉伸in文件报错求助 急
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错误提示: domain too large for neighbor bin 还有一个问题之前用的一个deform的fix之后，用vmd显示是一直拉长的，而没有拉断，是不是我还少了点什么？求大神帮忙！  PS：碳的lj势函数参数是epsilon sigma是0.4396 和0.03851吗？如果不是，是什么？ in文件如下 #------------------INITIALIZATION------------------ units lj dimension 3 atom_style atomic boundary s s p #------------------AYOM DEFINITION------------------ read_data data.txt #------------------FORCE FIELD------------------ #------------------potentials------------------ pair_style lj/cut 30 pair_coeff * * 0.4396 0.03851 neighbor 0.1 bin neigh_modify delay 5 check yes #------------------initial velocities------------- region 1 block INF INF INF INF INF 3 group lower region 1 region 2 block INF INF INF INF 17 INF group upper region 2 group boundary union lower upper group mobile subtract all boundary velocity lower set 0.0 0.0 0.0 #设置left区域原子初速度为0 velocity upper set 0.0 0.0 0.3 #设置right区域z方向原子速度为0.3 velocity mobile ramp vz 0.0 0.3 z 3 17 sum yes thermo_style multi thermo 50 min_style sd #能量最小模式 minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 10000 #驰豫 fix 1 lower setforce 0.0 NULL NULL #固定下边的原子 thermo 200 #每200步输出一次结果 timestep 0.003 #时间步长0.003ps run 5000 #运行5000步 timestep 1.0 fix 3 all nve fix 4 all temp/rescale 300 1.0 1.0 5 1.0 fix 5 all deform 1000 z erate 0.002 units box #设置沿z方向拉伸，应变率为0.002(1/ps) dump 1 all atom 232 dump.lammmpstrj min_style sd minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 10000 run 100000 本人小本科生，刚接触lammps,求大神解答！ |
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2楼2018-07-26 10:36:40
