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半半911

新虫 (小有名气)

[求助] 扩增片段大小约5Kb的cDNA片段已有2人参与

本人最近实验要扩增一段约5Kb的cDNA(其中有1Kb左右GC含量比较高,约70%),试过各种酶都没有效果(La taq, La with GC buffer,  primer star, primer star GXL),请问有扩增 过这种片段的经验的怎么解决?或者帮忙推荐哪个公司可以提供扩增这种大片段的技术服务。谢谢!!!
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半半911

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-05-03 16:00:46
我也遇到过这种情况,解决方案可能有两个。一个是酶,曾经用过takara的一种酶扩增效率很高,但保真性没有那么好。不记得全称了,好像室友Amp这几个字母,你可以查查,推荐一下。第二个是你的反应体系和程序,引物多 ...

就是想得到基因的全长,接下来做酵母双杂,过表达等
5楼2015-05-03 21:14:25
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-05-05 22:44:20
我也遇到过这种情况,解决方案可能有两个。一个是酶,曾经用过takara的一种酶扩增效率很高,但保真性没有那么好。不记得全称了,好像室友Amp这几个字母,你可以查查,推荐一下。第二个是你的反应体系和程序,引物多合成两对,PCR程序多试试。另外,如果只是想得到序列不做下一步,建议分段扩增。

基因克隆是个耐心活。祝顺利。
2楼2015-05-03 16:00:46
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lixg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
半半911: 金币+5, 有帮助 2015-05-03 21:13:33
建议:用NEB公司的phusion酶,用其自带的GC buffer或其他公司的GC buffer均可。扩增时退火温度设定为引物Tm值+2度,其它条件按说明书进行。该酶对扩增长片段很有效,且保真性超高。祝你好运!
3楼2015-05-03 16:56:46
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半半911

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lixg at 2015-05-03 16:56:46
建议:用NEB公司的phusion酶,用其自带的GC buffer或其他公司的GC buffer均可。扩增时退火温度设定为引物Tm值+2度,其它条件按说明书进行。该酶对扩增长片段很有效,且保真性超高。祝你好运!

接下来去订购一个试试
6楼2015-05-03 21:14:51
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