【答案】应助回帖

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1楼2015-04-29 11:14:48

赵红霞

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【答案】应助回帖

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在MS里Al比较特殊，因为力场分配的原因要删除共价键，你这个就不需要删除共价键了，分配完力场之后自己检查一下就知道了。

2楼2015-04-30 09:00:53

houchaojian

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引用回帖:

2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-04-30 09:00:53
在MS里Al比较特殊，因为力场分配的原因要删除共价键，你这个就不需要删除共价键了，分配完力场之后自己检查一下就知道了。

嗯我知道了采用COMPASS力场几何优化的时候，出现以下问题

Energy contributors with missing parameters:
Inversion                : (o si4z si4z si4z), (si o o2z o2z), (si o2z o2z o),
                              : (si o2z o2z o2z), (si4z o o2z o2z), (si4z o2z o2z o),
                              : (si4z o2z o2z o2z)

Energy contributors using automatic parameters:
Bond Stretch             : (o si), (o si4z), (o2z si)
Angle Bend                : (o si o2z), (o si4z o), (o si4z o2z), (o2z si o2z),
                              : (si o2z si), (si o2z si4z), (si4z o si4z)
Torsion                   : (si o2z si o), (si4z o2z si o), (si o2z si o2z),
                              : (si4z o2z si o2z), (si4z o si4z o2z)

3楼2015-04-30 14:07:00

houchaojian

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上述问题的出现是不是力场选的不合适呢

4楼2015-04-30 16:14:58

赵红霞

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引用回帖:

3楼: Originally posted by houchaojian at 2015-04-30 14:07:00
嗯我知道了采用COMPASS力场几何优化的时候，出现以下问题

Energy contributors with missing parameters:
Inversion : (o si4z si4z si4z), (si o o2z o2z), (si o2z o2z o),
...

出现这个问题是因为有些原子没有分配到合理的力场，你自己检查一下提示中提到的这几个地方的结构是否合理

5楼2015-05-01 08:54:37