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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 径向分布函数的归一化
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MDeFF2012

新虫 (小有名气)

[求助] 径向分布函数的归一化 已有2人参与

想请教一下，利用compute/rdf计算出来的RDF如何归一化？
径向分布函数的归一化
1.jpg
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1楼 2015-04-27 18:02:41
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用这个命令出来就应该是归一的，检查一下，是否有参数设置错误？或者把in文件中相关命令贴出来让大家看看
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2楼2015-04-28 07:38:10
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chuntao118

新虫 (著名写手)
貌似在计算时没有除粒子数所致！你的粒子数应该是1000吧？关键是你的计算（RDF）程序拿出来大家才能知道。
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3楼2015-04-28 08:30:30
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MDeFF2012

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-04-28 07:38:10
用这个命令出来就应该是归一的，检查一下，是否有参数设置错误？或者把in文件中相关命令贴出来让大家看看

做的是冲击的rdf，是不是和静态的不一样？
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4楼2015-04-28 10:58:47
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abinitio

版主 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by MDeFF2012 at 2015-04-28 10:58:47
做的是冲击的rdf，是不是和静态的不一样？...

应该差不多。把fix语句贴出来看看
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5楼2015-04-28 11:25:30
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MDeFF2012

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by abinitio at 2015-04-28 11:25:30
应该差不多。把fix语句贴出来看看...

compute         RDF3 3 rdf 50
fix             RDF3 3 ave/time 100 1 100 c_RDF3 file tmp20km_3.rdf mode vector
有什么不对吗
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6楼2015-05-11 10:54:12
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没落的华丽

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by MDeFF2012 at 2015-05-11 10:54:12
compute         RDF3 3 rdf 50
fix             RDF3 3 ave/time 100 1 100 c_RDF3 file tmp20km_3.rdf mode vector
有什么不对吗...

楼主解决这个问题了吗，我的数值虽然不大，但是也不是1
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7楼2015-09-26 21:51:02
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未曾彷徨

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 没落的华丽 at 2015-09-26 21:51:02
楼主解决这个问题了吗，我的数值虽然不大，但是也不是1...

这个命令算的结果本来就不是归一化的，去wiki看看 RDF (Radial distribution function) 的定义就清楚了。
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8楼2015-10-19 22:04:57
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