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逆光飞翔

新虫 (初入文坛)

[求助] 急须构建进化树,这几天交初稿,望帮忙,非常非常感想!!! 已有1人参与

求助!急~~两株放线菌测了很久,最近测序出来,也还没有拼接,过几天就要交论文初稿了,现要构建进化树,看了一下帖子下了Mega软件还是脑子浆糊,所以只能紧急求助万能的虫友。希望有熟练的能抽点时间帮我构建个系统进化树,我愿悬赏150金币,非常非常感想!(文件中的菌种分别为P1和R1,送了备样,都是备样2测出来了,所以返回的文件写着P1-2和R1-2,双向测序。)
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  • 附件 1 : 菌种P1和R1的测序结果.zip
  • 2015-04-26 20:34:52, 620.21 K

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王丹2013

金虫 (正式写手)

比对了下你的序列,测出来大部分是载体上的序列,完全不知道你的是什么放线菌,怎么建进化树
2楼2015-04-26 21:43:54
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逆光飞翔

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王丹2013 at 2015-04-26 21:43:54
比对了下你的序列,测出来大部分是载体上的序列,完全不知道你的是什么放线菌,怎么建进化树

不会吧,测了好久才测出来的,直接提pcr条带很亮却说浓度低,所以只好做蓝白斑了。但是连接的时候没有酶切,用的通用引物27F/1492R,载体pMD19-T,菌种是蜜柚中提取出的内生菌。是不是算失败了,好惨好惨~~~
3楼2015-04-26 22:58:13
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王丹2013

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 逆光飞翔 at 2015-04-26 22:58:13
不会吧,测了好久才测出来的,直接提pcr条带很亮却说浓度低,所以只好做蓝白斑了。但是连接的时候没有酶切,用的通用引物27F/1492R,载体pMD19-T,菌种是蜜柚中提取出的内生菌。是不是算失败了,好惨好惨~~~...

做TA克隆不需要酶切的呀,你还是自己先把序列确定了吧,不然别人没法帮你画进化树
4楼2015-04-27 08:52:32
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小小细胞啊

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王丹2013 at 2015-04-26 21:43:54
比对了下你的序列,测出来大部分是载体上的序列,完全不知道你的是什么放线菌,怎么建进化树

能不能把MEGA软件发给我一下啊  我也要见树   非常感谢您的帮助
5楼2015-05-21 18:53:21
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王丹2013

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小细胞啊 at 2015-05-21 18:53:21
能不能把MEGA软件发给我一下啊  我也要见树   非常感谢您的帮助...

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  • 附件 1 : MEGA4_Setup.exe
  • 2015-05-22 16:28:50, 8.24 M
  • 附件 2 : mega4.pdf
  • 2015-05-22 16:28:57, 1.13 M
6楼2015-05-22 16:29:07
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