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清泥-3

金虫 (小有名气)

[求助] Kinetic Monte carlo动力学蒙特卡罗模拟化学反应。。 已有3人参与

各位虫友们,有谁对做过动力学蒙特卡罗模拟化学反应? 求指导呀,最近老师让我研究这个,真心看不懂?有哪位大神能够指导下,感激不尽。。。做模拟的时候初始模型是随意给定的还是?如果某个事件能够发生,比如反应A能生成B, 在模拟的时候是不是只在某个格点上发生一次这样的事情,然后进入到下一个循环,还是所有的满足的格子上面的A都能生成B。?
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刚刚开始接触,以后还要继续努力学习。
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kjsun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 清泥-3 at 2015-04-27 16:14:50
脱附过程,是用什么算法,BKL,还是第一反应法,还是别的,这些算法的使用是不是看自己的选择,还是说根据自己要模拟什么来定?...

我被你吓到了,因为我根本不知道BKL和第一反应法是什么区别。
好吧,我承认我不是这个领域的人,我是外行。

我用KMC模拟的是吸附分子的程序升温脱附(TPD)过程
表面上的吸附的分子有两种行为:扩散和脱附 (忽略再吸附的可能)
扩散远远快于脱附,所以:
1. 让分子扩散,直到扩散平衡。
2. 随机选择一分子,让其脱附,计算时间变化 t= -ln(随机数)/脱附率的加和, 和新的温度值 T=前一步温度+t*升温速度
3 如果T未达到结束温度, 跳转1。否则,中止,结束。
把每个T下的值画出来,就是TPD的结果。


简单到我都不好意思说了。
6楼2015-04-28 12:29:01
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清泥-3

金虫 (小有名气)

怎么都没有人搭理?
刚刚开始接触,以后还要继续努力学习。
2楼2015-04-27 09:55:03
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kjsun

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
清泥-3: 金币+30, ★★★很有帮助 2015-05-04 11:13:10
模拟的时候初始模型是随意给定的还是?如果某个事件能够发生,比如反应A能生成B, 在模拟的时候是不是只在某个格点上发生一次这样的事情,然后进入到下一个循环,还是所有的满足的格子上面的A都能生成B。?

答:初始模型是在满足一些条件的情况下,随便定的。
   一般是:某个格子上的A生成B,然后进入下一循环。




特别提醒:我没做过KMC模拟反应。
我做的是模拟脱附过程,
所以仅供参考。
3楼2015-04-27 10:27:22
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清泥-3

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by kjsun at 2015-04-27 10:27:22
模拟的时候初始模型是随意给定的还是?如果某个事件能够发生,比如反应A能生成B, 在模拟的时候是不是只在某个格点上发生一次这样的事情,然后进入到下一个循环,还是所有的满足的格子上面的A都能生成B。?

答:初 ...

脱附过程,是用什么算法,BKL,还是第一反应法,还是别的,这些算法的使用是不是看自己的选择,还是说根据自己要模拟什么来定?
刚刚开始接触,以后还要继续努力学习。
4楼2015-04-27 16:14:50
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