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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 多肽做LC-ESI-MS/MS后如何分析氨基酸序列
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zouye_198661

新虫 (初入文坛)

[求助] 多肽做LC-ESI-MS/MS后如何分析氨基酸序列已有2人参与

我在外文文献里看到用LC-ESI-MS/MS分析多肽的氨基酸序列，其中提到用Proteome Discoverer software和Uniprot Database,请问各位大侠具体如何操作啊 ？我有LC-ESI-MS/MS的图，但是不会解析，我们学校分析中心的老师也是新来的，他也不会，请教各位大侠帮助。
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1楼2015-04-20 17:36:50
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
老师，您好，我们这边能做这方面的分析！不过是得收费，例如PLS-DA、OPLS-DA等分析和模型的建立
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生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-04-20 22:58:46
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zouye_198661

新虫 (初入文坛)
希望有知道的大侠回复~~~
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3楼2015-04-21 20:53:16
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好朋友的祝福

木虫 (正式写手)
如果仅仅依靠LC-ESI-MS/MS分析多肽的氨基酸序列 ，那是分析不出来的
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4楼2015-04-22 10:51:23
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zouye_198661

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 好朋友的祝福 at 2015-04-22 10:51:23
如果仅仅依靠LC-ESI-MS/MS分析多肽的氨基酸序列 ，那是分析不出来的

请问大侠具体的多肽的氨基酸序列该用什么方法？ 十分感谢
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5楼2015-04-23 08:42:49
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好朋友的祝福

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zouye_198661 at 2015-04-23 08:42:49
请问大侠具体的多肽的氨基酸序列该用什么方法？ 十分感谢...

这个我们也没做过测序！一般外送吧！MS只提供一个分子量的图谱，你多肽序列里面的氨基酸随便组合还是一个MS
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6楼2015-04-24 13:20:14
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zouye_198661

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 好朋友的祝福 at 2015-04-24 13:20:14
这个我们也没做过测序！一般外送吧！MS只提供一个分子量的图谱，你多肽序列里面的氨基酸随便组合还是一个MS...

谢谢
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7楼2015-04-25 08:52:26
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

you need the MS/MS spectral file.
Generally two ways: database search and de novo
Widely used software include: mascot, maxquant, ms-gf+, searchgui  etc.
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8楼2015-04-25 09:44:05
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MHSW

禁言 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
9楼2015-09-23 09:31:13
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