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juan_819

铁虫 (初入文坛)

[求助] 本人分子生物小白一枚,刚刚开始做pcr,目前在扩cDNA的全长 。。。 已有4人参与

我已经设计了两对引物。第一对做的不太成功。第二对今天早上做了一下可以扩出来一些。在1500bp附近有我需要的目的基因,但是我用早上的产物做二次扩增的时候却怎么也做不出来了。只有引物二聚体。想问一下,如果改用LAtaq酶会不会效果好一些,在引物、镁离子等浓度上有什么需要注意的地方,希望各位指点一下,谢谢。

本人分子生物小白一枚,刚刚开始做pcr,目前在扩cDNA的全长 。。。
上午做梯度的结果


本人分子生物小白一枚,刚刚开始做pcr,目前在扩cDNA的全长 。。。-1
用第四第五管做二次pcr的结果
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慕辰sherry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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引用回帖:
13楼: Originally posted by 18761615793 at 2015-04-16 08:57:30
目前用的是什么酶? 不建议使用LA Taq酶,因为它专门针对长片段(起码也得8kb以上),你现在是1500bp不算长片段,扩增效果可能会适得其反,(当然成功也有可能,毕竟是分子实验看不见摸不着的)
建议可以尝试降落P ...

现在用的是rtaq酶。我做过梯度了,50-60之间。因为设计引物的时候,两个都在60度左右。第一张图就是我做梯度的结果。就是扩出来的目的片段很淡,我不知道怎么优化条件

[ 发自小木虫客户端 ]
15楼2015-04-16 12:44:31
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Sunshine092

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-15 22:06:12
有引物二聚体可以尝试提高一下退火温度,目的条带暗可以增加循环数,至于说用pcr产物做模板继续pcr一般是需要稀释产物之后再做二次pcr。
2楼2015-04-15 16:54:05
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wjasaa

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-15 22:06:29
两次都是引物加太多了,一轮PCR出来目的片段就很少,大部分都是二聚体,用这个做模板没有条带也正常。
建议一轮PCR重做,减少引物量。
WWW.ABMGOOD.COM
3楼2015-04-15 16:56:39
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慕辰sherry

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Sunshine092 at 2015-04-15 16:54:05
有引物二聚体可以尝试提高一下退火温度,目的条带暗可以增加循环数,至于说用pcr产物做模板继续pcr一般是需要稀释产物之后再做二次pcr。

我已经用40个循环了,还可以在继续加么
4楼2015-04-15 17:08:57
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