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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » RACE后是单链的cDNA吗？
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混合配搭

新虫 (小有名气)

[交流] RACE后是单链的cDNA吗？

RACE后测得的序列是单链的cDNA吗？要是单链的话。可以用单链的序列BLAST，从而进行分析吗？刚接触，希望有好心的大神讲解一下哦。
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1楼 2015-04-15 00:04:42
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mlbiosci

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
20楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-16 22:59:27
如果得到了一段序列，我想预测它的蛋白功能，应该从哪开始呢...

ORFfinder预测开放阅读框，翻译成氨基酸序列，再结合相关文献，利用相关数据库(很多网上能搜到)预测

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21楼2015-04-16 23:35:33
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mlbiosci

新虫 (正式写手)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-15 22:07:34
Race后也是基于反转录，以cdna为模板pcr得到的序列测序
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2楼2015-04-15 00:20:37
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混合配搭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mlbiosci at 2015-04-15 00:20:37
Race后也是基于反转录，以cdna为模板pcr得到的序列测序

哦，那就是说扩增出来的就是Cdna 的全长呗。
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3楼2015-04-15 07:53:44
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mlbiosci

新虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
混合配搭: 金币+2 2015-04-15 13:51:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-15 07:53:44
哦，那就是说扩增出来的就是Cdna 的全长呗。...

不见得是全长，看你从哪个地方开始进行，最少也是5“  3“ 两个部分，分别测序后序列组装

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4楼2015-04-15 08:44:32
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