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hjy2940

铜虫 (小有名气)

[求助] towhee_coords文件建立

新手准备用xyz2towhee.F 把 xyz 文件转成towhee_coords文件，但是出现error: bad real number in item2 of list input.

上传了xyz文件，谢谢！
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  • 附件 1 : saturateC22.xyz
    • 2015-04-13 01:12:18, 4.2 K

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hjy2940

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1楼 2015-04-13 00:59:12
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紫霞咸鱼

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 043114076 at 2015-04-14 08:36:56
你试试改成这样:
11

C   -1.237433   -0.270451    0.000041   
C   -0.015815    0.639043    0.000041   
C    1.249296   -0.208910    0.000041   
H   -2.161969    0.349227    0.000041   
H   ...

改成这样的一个XYZ文件后，怎么转成towhee_coords呢？看官网手册不太明白
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6楼2017-05-23 11:08:02
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
hjy2940(abinitio代发): 金币+5, 鼓励交流. 正解 2015-04-13 10:46:30
你这个不是xyz的文件格式, 正确的格式应该是
68

CT  -12.975700    1.539540   -0.000000  
CT  -11.613400    2.220430   -0.000000  
CT  -10.516800    1.163540   -0.000000  
CT   -9.154480    1.844430   -0.000000  
CT   -8.057890    0.787542   -0.000000  
CT   -6.695570    1.468440   -0.000000  
CT   -5.598980    0.411546   -0.000000  
CT   -4.236660    1.092440   -0.000000  
CT   -3.140070    0.035549   -0.000000  
CT   -1.777750    0.716444   -0.000000  
CT   -0.681159   -0.340447   -0.000000  
CT    0.681159    0.340447   -0.000000  
CT    1.777750   -0.716444   -0.000000  
CT    3.140070   -0.035549    0.000000  
CT    4.236660   -1.092440    0.000000  
CT    5.598980   -0.411546    0.000000  
CT    6.695570   -1.468440    0.000000  
CT    8.057890   -0.787542    0.000000  
CT    9.154480   -1.844430    0.000000  
CT   10.516800   -1.163540    0.000000  
CT   11.613400   -2.220430    0.000000  
CT   12.975700   -1.539540    0.000000  
HC~1  -13.777100    2.311910   -0.000000  
HC~1  -13.072700    0.905024   -0.909258  
HC~1  -13.072800    0.904397    0.908810  
HC~1  -11.516400    2.854940    0.909258  
HC~1  -11.516300    2.855570   -0.908810  
HC~1  -10.613800    0.529028   -0.909258  
HC~1  -10.613900    0.528400    0.908810  
HC~1   -9.057450    2.478940    0.909258  
HC~1   -9.057360    2.479570   -0.908810  
HC~1   -8.154910    0.153031   -0.909258  
HC~1   -8.155010    0.152403    0.908810  
HC~1   -6.598540    2.102950    0.909258  
HC~1   -6.598450    2.103580   -0.908810  
HC~1   -5.696000   -0.222965   -0.909258  
HC~1   -5.696100   -0.223593    0.908810  
HC~1   -4.139630    1.726950    0.909258  
HC~1   -4.139540    1.727580   -0.908810  
HC~1   -3.237090   -0.598962   -0.909258  
HC~1   -3.237190   -0.599590    0.908810  
HC~1   -1.680730    1.350960    0.909258  
HC~1   -1.680630    1.351580   -0.908810  
HC~1   -0.778184   -0.974959   -0.909258  
HC~1   -0.778280   -0.975586    0.908810  
HC~1    0.778184    0.974959    0.909258  
HC~1    0.778280    0.975586   -0.908810  
HC~1    1.680730   -1.350960   -0.909258  
HC~1    1.680630   -1.351580    0.908810  
HC~1    3.237090    0.598962    0.909258  
HC~1    3.237190    0.599590   -0.908810  
HC~1    4.139630   -1.726950   -0.909258  
HC~1    4.139540   -1.727580    0.908810  
HC~1    5.696000    0.222965    0.909258  
HC~1    5.696100    0.223593   -0.908810  
HC~1    6.598540   -2.102950   -0.909258  
HC~1    6.598450   -2.103580    0.908810  
HC~1    8.154910   -0.153031    0.909258  
HC~1    8.155010   -0.152403   -0.908810  
HC~1    9.057450   -2.478940   -0.909258  
HC~1    9.057360   -2.479570    0.908810  
HC~1   10.613800   -0.529028    0.909258  
HC~1   10.613900   -0.528400   -0.908810  
HC~1   11.516400   -2.854940   -0.909258  
HC~1   11.516300   -2.855570    0.908810  
HC~1   13.777100   -2.311910    0.000000  
HC~1   13.072700   -0.905024    0.909258  
HC~1   13.072800   -0.904397   -0.908810  
注意68下面有空行,你试一下!
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2楼2015-04-13 08:41:01
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hjy2940

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
谢谢，我再试试

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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材料
3楼2015-04-13 08:49:45
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hjy2940

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 043114076 at 2015-04-13 08:41:01
你这个不是xyz的文件格式, 正确的格式应该是
68

CT  -12.975700    1.539540   -0.000000  
CT  -11.613400    2.220430   -0.000000  
CT  -10.516800    1.163540   -0.000000  
CT   -9.154480    1.8444 ...

按照上面格式改了，为什么还是同样的错误，

我试了一个简单分子的xyz
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  • 附件 1 : try.xyz
    • 2015-04-13 19:57:52, 506 bytes
材料
4楼2015-04-13 19:58:14
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