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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

引用回帖:
10楼: Originally posted by hairan at 2015-04-11 23:45:58
高斯的优化模块有设定,默认的最大优化步数是冗余内坐标数目的2倍。
1、对于冗余内坐标数目小于50个体系,可以通过maxcycle选项来加大最大优化步数,但最多只能提高到100步。
2、对于冗余内坐标数目大于等于50个的 ...

冗余内坐标就是写在分子坐标下面的那些数字和字母吧,好像没有54个啊
11楼2015-04-12 00:01:11
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-04-12 06:38:09
引用回帖:
11楼: Originally posted by lastzealot at 2015-04-12 00:01:11
冗余内坐标就是写在分子坐标下面的那些数字和字母吧,好像没有54个啊...

根据我的理解,你说的数字和字母是输入文件坐标下面的原子连接关系,一般有多少个原子就有多少行,一般来说都比冗余内坐标数量少得多。
在输出文件中在读入了分子坐标之后,程序会自动构建冗余内坐标,形式如下。
! R23   R(21,22)                0.9644         estimate D2E/DX2                !
! A1    A(6,1,19)             120.3155         estimate D2E/DX2                !
! D1    D(19,1,6,3)            77.927          estimate D2E/DX2                !
可能我开始说的两倍不一定都是如此,但最大优化步数肯定与这些坐标的数量成正比关系。
另外,分子的具体结构和分子对称心对最大步数的计算好像都有影响。
我刚才看了我之前计算的一个分子,有233个冗余内坐标,没有对称性,这个分子优化中允许的最大步数是234。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
12楼2015-04-12 04:08:14
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