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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 高斯计算求助！！！
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q1w2e38672

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算求助！！！

本人是做合成的，合成了一系列液态物质，比较看重其中两个原子硅和氮之间的距离，核磁结果不能准确的说明硅氮之间的距离或者说是否成键。由于对计算不是很了解，询问过之后选取的B3LYP/6-31 g 进行了优化 。 然后审稿意见如下1.        The authors tried to use DFT computation to predict the geometries of these compounds. But this type of DFT computation is designed for systems in the gas phase under standard conditions. It is questionable if the computational results could well represent molecules in the liquid phase.

2.        B3LYP is a common functional for small molecules. But there are other methods that are known for their sensitivity to weak interactions (non-covalent interactions) such as M06 and PBE. If the authors insist on using DFT computation (given its limitation representing the actual compounds in liquid phase), justification on the choice of functional (B3LYP in this case) would be appreciated. 我现在想请教一下大家怎么改进才能解决我的问题 让结果有说服力？
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1楼 2015-03-06 14:12:43
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q1w2e38672

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgx1012lgx at 2015-03-08 00:44:22
你在液态下用密度泛函b3算，然后同时用m06系列和PBS系列在液态下计算，并与你的结果对比,最好选四五个这样的从头算

谢谢 ~麻烦您能不能说明白一点~液态是指限定溶剂吗？除了这几个还有什么可以用呢？
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4楼2015-03-08 09:07:16
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q1w2e38672

铁杆木虫 (小有名气)
其实最核心的问题是我的结构里主题是一个硅两个氮，现在从核磁上看两硅氮键是等价的，核磁为对称。但是毕竟核磁也不能说明问题，因此考虑到了计算优化结构，但是优化结果显示两个键长差别非常之大1.8,2.8的差别。这与核磁就出现了矛盾。刚好拿到了一个类似物质的单晶，两个硅氮键分别为1.8,2.6，核磁很奇怪的也是表明对称？这个该如何解释呢？
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2楼2015-03-06 14:47:03
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匿名

用户注销 (著名写手)
★
ben_ladeng: 金币+1, 谢谢指教 2015-03-10 07:37:29
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3楼2015-03-08 00:44:22
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匿名

用户注销 (著名写手)
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5楼2015-03-10 22:05:25
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