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402377100

金虫 (小有名气)

[求助] 请问如何提取植物中共生真菌的mRNA 已有3人参与

本人欲做与植物共生真菌和非共生真菌的差异表达,非共生真菌可以直接用培养基培养研磨菌丝一步步提取RNA,但是如何提取与植物共生的真菌RNA呢?共生的真菌侵入植物细胞中与植物共生,若对染菌植物整体材料进行研磨提RNA,那就混有大量植物RNA,请问各位大神用什么方法能提取与植物共生的真菌RNA呢?
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心之所向,无怨无悔
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-02-02 10:15:30
402377100: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢您,您的回答对我很有帮助。 2015-02-05 11:53:56
首先,你要植物共生真菌和非共生真菌的差异表达,植物的rna不会影响你的实验结果,完全没有必要单独提取真菌rna。如果非要把共生真菌的转录组提纯出来,你可以用扣除杂交的方法,把染菌的总rna提出来,反转录,未染菌的植物rna也提出来,混合杂交,过柱,剩下的cDNA就是真菌特有的了,方法在分子克隆上有。也可以用抑制性差减杂交SSH,应该更稳定一点,而且有试剂盒

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2015-02-02 09:14:49
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402377100

金虫 (小有名气)

自己顶一下,跪求大神解答!
心之所向,无怨无悔
2楼2015-02-01 20:13:57
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-02-02 10:15:23
402377100: 金币+5, 有帮助, 多谢O(∩_∩)O~ 2015-02-05 11:54:45
这个研究很少吧。没见过报道 啊
3楼2015-02-01 22:27:57
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402377100

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by titus0805 at 2015-02-02 09:14:49
首先,你要植物共生真菌和非共生真菌的差异表达,植物的rna不会影响你的实验结果,完全没有必要单独提取真菌rna。如果非要把共生真菌的转录组提纯出来,你可以用扣除杂交的方法,把染菌的总rna提出来,反转录,未染 ...

太感谢了,按照您的方法试一试!
心之所向,无怨无悔
5楼2015-02-04 19:43:54
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