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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物化学 » 如何查找酶的活性部位
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meng1010

金虫 (小有名气)

[求助] 如何查找酶的活性部位 已有1人参与

请问各位朋友，我现在在做一个酶的活性及作用，我想对这个酶的活性区域进行突变，使其失去酶的活性，但是不知道利用什么软件或者通过何种途径才能查到这个酶的活性位点，文献查阅这个酶的活性区域大约有200个氨基酸，这个范围太大了，想请教一下如何才能知道这个酶的关键活性区域，将范围缩小，或者有什么软件可以查找吗？请大家指教，谢谢！
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1楼 2015-01-18 16:56:13
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meng1010

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ptttmt at 2015-01-19 10:20:34
在线的软件，具体网址百度一下
...

您好！根据您的提示，我用swiss-model对我关心的基质金属蛋白酶进行了分析，但是看不懂结果说的什么意思。能麻烦您帮我看一下吗？谢谢！
  http://swissmodel.expasy.org/wor ... p;amp;prjid=P000001
这是网址，谢谢！
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7楼2015-01-26 16:29:27
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-01-18 22:50:02
具体什么酶？用SMART进行结构域和活性位点分析应该可以分析出来，另外可以用swiss-model模建空间结构，会给出系统自动选用的蛋白模板，里面会有具体的信息

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meng1010 meng1010
2楼2015-01-18 17:29:52
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meng1010

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ptttmt at 2015-01-18 17:29:52
具体什么酶？用SMART进行结构域和活性位点分析应该可以分析出来，另外可以用swiss-model模建空间结构，会给出系统自动选用的蛋白模板，里面会有具体的信息

谢谢！我想你问一下SMART和swiss-mode这两个软件就可以自动分析吗？在网上可以下载到吗？
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3楼2015-01-19 08:27:23
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meng1010

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ptttmt at 2015-01-18 17:29:52
具体什么酶？用SMART进行结构域和活性位点分析应该可以分析出来，另外可以用swiss-model模建空间结构，会给出系统自动选用的蛋白模板，里面会有具体的信息

谢谢！请问这两个软件在网上可以下载到吗？用他们就可以分析了，对吗？
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4楼2015-01-19 08:28:38
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