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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于吸附能的计算问题
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半人马ALPHA

金虫 (正式写手)

[求助] 关于吸附能的计算问题 已有4人参与

大家好，我想请教两个问题。
问题1
对于预吸附分子表面上的吸附能的计算：
例如含硫表面上吸附CO的反应：
Ead = Ecomplex - E(surface+pre-S) - E(CO)
如果，含硫表面吸附CO分子优化之后，表面S的位置发生了明显改变（与不吸附CO的含硫表面上S的位置不同），应该如何计算CO的吸附能？
问题2
如果含硫表面上进行反应，S的位置在起始态与终态不同，搜索出的过渡态，计算出的反应能垒又该如何校正呢？是否需要减去一个S在表面迁移的能垒？

希望大家给出一点意见，十分感谢。我用的软件是VASP
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1楼 2015-01-13 11:39:28
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2015-01-14 08:16:51
半人马ALPHA: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-01-14 10:49:33
半人马ALPHA: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-01-14 18:24:37
不用考虑修正的问题。S的变化是由于CO吸附过程引起的。吸附能表达的是吸附过程所释放的能量，只与始态和终态能量相关，而与具体原子怎么变动的没有关系。
反应能垒也是，只要反应过程，始态——过渡态——终态，反应物脱附后，表面能够回到反应前的样子，就可以通过原来的式子计算，如果反应过后，表面回不到初态，那么，反应模型肯定不会理，会受人质疑，毕竟宏观上，反应应该是个连续的过程，不是一次性的，对吧
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8楼2015-01-13 20:25:59
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普通回帖

stractor

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖！ 2015-01-14 08:16:08
半人马ALPHA: 金币+4, ★★★很有帮助 2015-01-14 10:49:49
就是用你给出那个公式计算，吸附后原子位置是有变化。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2015-01-13 13:03:28
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aaronzjw

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖！ 2015-01-14 08:16:21
只要变化不是很夸张都可以接受，变化很大就考虑表面重构了。或者也有可能是你人为原因，再重复几遍试试
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3楼2015-01-13 15:05:51
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半人马ALPHA

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by aaronzjw at 2015-01-13 15:05:51
只要变化不是很夸张都可以接受，变化很大就考虑表面重构了。或者也有可能是你人为原因，再重复几遍试试

如果考虑重构的话，怎么修正？？
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4楼2015-01-13 15:26:18
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半人马ALPHA

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stractor at 2015-01-13 13:03:28
就是用你给出那个公式计算，吸附后原子位置是有变化。

如果变化比较大呢？S原子被吸附分子排斥，吸附优化后的表面S原子位置发生了变化
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5楼2015-01-13 15:27:41
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stractor

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 半人马ALPHA at 2015-01-13 15:27:41
如果变化比较大呢？S原子被吸附分子排斥，吸附优化后的表面S原子位置发生了变化...

一样的
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6楼2015-01-13 17:17:55
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半人马ALPHA

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by stractor at 2015-01-13 17:17:55
一样的...

您说的一样，就是我还用那个公式？？？E(surface+pre-S)还是预吸附S的表面优化后的能量？？
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7楼2015-01-13 18:50:10
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半人马ALPHA

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2015-01-13 20:25:59
不用考虑修正的问题。S的变化是由于CO吸附过程引起的。吸附能表达的是吸附过程所释放的能量，只与始态和终态能量相关，而与具体原子怎么变动的没有关系。
反应能垒也是，只要反应过程，始态——过渡态——终态，反 ...

您说的反应回到反应前的样子就是指，pre-covered S原子在原先的位置，含硫表面能量最低吧
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9楼2015-01-13 21:23:38
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stractor

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

我和前面的都说了，吸附过程肯定会导致原子位置的改变。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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10楼2015-01-13 23:46:44
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