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moshangchenx

金虫 (正式写手)

[求助] 目的片段一端是粘性末端,一端是平末端与相应载体的连接如何提高效率?急!已有12人参与

我最近在做一个片段与载体的连接构建一个质粒,连了很多次都没连上.
具体如下:我的目的片段一端是粘性末端(Spe I 酶切位点),一端是平末端(SMA I 酶切位点).片段是PCR后连在T载体上测序正确,双酶切效果可以切出两条相应大小的片段.载体是pDBLeu,内含Spe I 与SMA I 酶切位点.其双酶切出的片段与未酶切的片段有电泳大小的区别.目的片段与载体我都双酶切后进行胶回收用去离子水溶解.回收产物电泳可看到模糊条带.
我做了十几次片段与载体不同浓度的连接,Takara Solutiuon I 、TIANGEN的T4DNA连接酶进行16度过夜连接以及用PCR仪进行过夜变温连接,用未酶切的pDBLeu质粒做阳性对照.结果,阳性对照的平板上每次都产生很多菌落,但做连接的板上一个菌落都没有.载体双酶切后片段长9800多bp,目标片段为1800多bp。
做了很多次了都如此,都快做的没信心做下去了,有哪个大哥大姐给我一些建设性意见吗?多谢了!!!
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科研无止境,我心成蹉跎
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木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
moshangchenx(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-01-15 20:00:50
重新制备载体和克隆片段,试试分别酶切,先切低盐缓冲液的酶,做下乙醇沉淀,再在与第一次等体积或加倍体积的体系切另一个酶,不要一下切2种酶。胶回收不要在紫外下照太久,胶回收等试剂盒最后洗脱下来的时候,如果用水,pH要在8.0这样,如果不好把握,建议用1/10-1/2浓度的TE(pH=8.0)。感受态细胞的转化效率有没有10^6以上?质粒转出来要很多才大道高的转化效率,一般多估计还不一定达到。T4 DNA连接酶反应体系中可以加一点ATP,有助于提高连接效率,酶的使用量按照平端的来添加,建议使用含高浓度T4 DNA连接酶的快速连接酶。
为什么
23楼2015-01-14 23:43:20
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

胶回收的时候先用AXYGEN的回收试剂盒,但效果不大好,之后采用冷冻离心经酚-氯仿抽提进行胶回收的
科研无止境,我心成蹉跎
2楼2015-01-12 09:08:50
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

也进行过4度过夜连接,但也没长,做了快两个月了,真心快崩溃了..........
科研无止境,我心成蹉跎
3楼2015-01-12 09:18:38
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
既然这么难做,为什么不试试换酶切位点呢?
4楼2015-01-12 10:00:14
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