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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

[交流] MS吸附能计算的问题

各位大神,本人用MS的CASTEP模块做吸附能计算,大概过程是:
1、根据FINDIT的数据构建的晶胞模型,没有做结构优化,因为优化后的参数跟实验值相差太大,所以没做优化
2、切面,选取的是(003)面,没有建立超晶胞,第一层和最低层原子是一样的。随后对该Slab进行了结构优化。计算了单点能。
3、计算了被吸附小分子的能量,直接建立分子结构优化后进行的单点能计算。
4、将优化后的小分子加到第二步优化后的Slab上,固定下面一半,上面一半弛豫。
定义吸附能=系统能量-之前单个的能量,根据这个计算得到的吸附能是正值,相当于该反应是吸热反应,这应该是不可能的。
备注:我计算的是NiCl2晶体表面的吸附。

请各位大神不吝赐教,本人感激不尽!
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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
19楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-15 15:48:31
FindIt 只有1963年发表的这一种晶体结构么?
我的意思是,如果还有更新的晶体结构,也可以导入计算一下,说不定老文献的数据不太可靠,那么就不是你计算的问题了。...

版主您好,关于NiCl2晶体结构确实只有那一篇。最近计算用的LDA函数,大概能算到2.89%和3.99%。
我用了一下Discover模块优化,发现我如果按照添加原子的方法建的晶胞会有很多的键,但实际上NiCl2应该是离子晶体不会出现共价键的呀,所以Discover总是无法进行优化,之后我把键都给删掉,就可以进行了。不过优化后的参数相差实在太大。
我师兄给我发了个NiCl2的cif文件,直接导入到MS中,出来的晶胞模型中确实没有共价键的存在。如图。
我现在不敢肯定那一种才是正确的构图方法,还是说两种都是可以的,参数都是一样的。请版主示教!!
http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1421600117_374.jpg
http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1421600124_232.jpg
MS吸附能计算的问题
3D Atomistic.jpg


MS吸附能计算的问题-1
NiCl2#14208.jpg

20楼2015-01-19 00:57:16
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DRP7

新虫 (小有名气)

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[ 发自iPhone7客户端 ]
2楼2015-01-11 23:44:24
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fentuo1203: 金币+10 2015-01-12 10:41:18
第一步存在问题,模拟计算一个很关键的问题就是:你如何证明,你选用的计算参数设置是合理的?如果不能解决这个问题,后续的吸附能计算结果的准确性也会受质疑。
一般说来,为了保证计算的可信,会采用做几何优化时的参数设置来做后续的计算。所以建议,几何优化这一步时调整计算参数(实际上这一块要做的工作很多,比如交换能相关函数、赝势、E-cutoff、k-points等参数的设置,这些都是CASTEP计算的最基础步骤),使得计算值和实验值相差<2%。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2015-01-12 08:59:00
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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-12 08:59:00
第一步存在问题,模拟计算一个很关键的问题就是:你如何证明,你选用的计算参数设置是合理的?如果不能解决这个问题,后续的吸附能计算结果的准确性也会受质疑。
一般说来,为了保证计算的可信,会采用做几何优化时 ...

版主您好,非常感谢您的指点,我对这些参数的设置也进行了一些尝试,但是得到的结果都有一个倾向,就是能量值上下波动,没有规律,所以也不收敛,我想知道产生这样的现象有哪些特定的原因。感谢!下面是其中一个优化的能量变化图。http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1421038685_320.jpg
MS吸附能计算的问题-2
NiCl2 cell Energies.jpg

4楼2015-01-12 12:58:27
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