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simonforever

新虫 (小有名气)

[求助] 如何查找单克隆抗体的基因序列 已有3人参与

如何查找单克隆抗体的基因序列？
想合成scFv单链抗体，必须知道当克隆抗体的基因序列，而且还要知道轻链和重链可变区的序列，设计引物
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1楼 2015-01-09 17:55:41
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匿名

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2楼2015-01-09 23:41:04
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zhangbighui

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
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simonforever: 金币+1 2015-01-12 20:44:28
V-BASE2这个数据库不错，可变区数据库，最全的了。
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成功，就是成为你想成为的人
5楼2015-01-11 19:38:01
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匿名

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★
simonforever: 金币+1 2015-01-12 20:44:37
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7楼2015-01-12 13:21:46
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匿名

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simonforever(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-10 20:02:22
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3楼2015-01-10 15:09:28
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simonforever

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by louis_cheung at 2015-01-09 23:41:04
能具体说一下要做什么抗体吗？每一种scfv或单抗的序列都是不一样的啊~是要查已知抗体吗？

我想做别人已经构建出的单抗的SCFv，不知道专利能查到吗？我试试哈，先谢过
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4楼2015-01-11 18:29:57
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匿名

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6楼2015-01-12 13:05:33
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zhangbighui

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by louis_cheung at 2015-01-12 13:21:46
(⊙o⊙)额，个人感觉V-BASE2可能算是抗体数据库中质量比较差的一个了，这个数据库快有十年没更新了，里面收录的人抗体胚系基因序列假基因太多，功能性基因序列太少。曾经把V-BASE2中所有的序列下载下来，通过KABAT ...

这个说的也有道理，我也只是把它提供的序列作为参考，我只做人的抗体，目前数据库的容量还够我用的，还有一个数据库IMGT用过吗
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成功，就是成为你想成为的人
8楼2015-01-13 13:42:24
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sanjiaocqp

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by louis_cheung at 2015-01-10 15:09:28
请问你是要做自己做的单抗还是别人已经报道的单抗？如果是前者，就没啥问题了；如果是后者的话，从文献或专利中可查找到其基因序列，找可变区的话直接用Kabat、Chothia等编码方案划分即可~~设计好scfv的氨基酸序列之 ...

你好，具体有查询抗体序列的指导文献或建议网站么
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9楼2017-03-21 15:53:37
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sanjiaocqp

新虫 (初入文坛)
你好，请问你现在找到了查找抗体基因序列的渠道么，求您指教
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10楼2017-03-21 15:55:16
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