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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 质谱分析得出了某种蛋白质，如何预测这种蛋白质的编码序列。
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fjswrww

铁虫 (小有名气)

[求助] 质谱分析得出了某种蛋白质，如何预测这种蛋白质的编码序列。已有1人参与

质谱分析得出了某种蛋白质，如何预测这种蛋白质的编码序列。？、？？？？？大神回答下。。。
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1楼2014-12-13 20:37:56
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-12-15 18:34:16
你都用质谱分析出蛋白了，不就已经有氨基酸序列了吗？
还是说你问的是DNA序列？DNA序列数据库里就能查出来
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The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
2楼2014-12-14 05:24:03
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fjswrww

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2014-12-14 05:24:03
你都用质谱分析出蛋白了，不就已经有氨基酸序列了吗？
还是说你问的是DNA序列？DNA序列数据库里就能查出来

要求，蛋白质的编码 DNA序列！这不是有很多种可能吗？不是同一种蛋白质可以由多个DNA序列编码！

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3楼2014-12-14 11:20:38
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人
引用回帖:
3楼: Originally posted by fjswrww at 2014-12-13 15:20:38
要求，蛋白质的编码 DNA序列！这不是有很多种可能吗？不是同一种蛋白质可以由多个DNA序列编码！
...

因为数据库里没有这个蛋白所以不知道DNA序列？不可能吧，质谱都是按照数据库搜的。
一般质谱能搜出来的，都有DNA序列吧。你这是什么物种的蛋白？
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The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
4楼2014-12-15 03:53:36
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fjswrww

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2014-12-15 03:53:36
因为数据库里没有这个蛋白所以不知道DNA序列？不可能吧，质谱都是按照数据库搜的。
一般质谱能搜出来的，都有DNA序列吧。你这是什么物种的蛋白？...

我们通过质普查出来的蛋白是，FGA，然后用NCBI查出来只有一个编码这个蛋白的序列！所以很疑惑，基因有简并性，不是应该有多种序列来编码？

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5楼2014-12-15 14:23:46
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