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秋之愚新虫 (正式写手)
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gauss软件优化时两个分子间的相对取相怎么固定 已有2人参与
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| 本人是gauss新手，最近在用gauss优化多分子体系的时候文献上说要固定两个分子的相对方向（relative orientation of the two molecules fixed），想问问各位大神们，比如两个H2O分子，他们的相对方向指的是什么啊，相对方向应该指的不是相对距离吧，还有这在gauss软件的输入文件里该怎么改。。。。。小弟在这先谢谢各位大神了。。。。。。 |
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13楼2014-12-15 15:20:47
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2楼2014-12-12 22:06:57
秋之愚
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这不是把分子的坐标固定了吗？各个分子本身的键长键角也还是要优化的。。。文章原文是这么写的 We first obtain the optimized geometry of NMA– D2O(A) complex, where the site A is occupied by a single water molecule. Then, the distance r between the hydrogen-bonding D atom of the D2O(A) and the oxygen atom of the NMA is increased, with the relative orientations of the two molecules fixed。。 |
3楼2014-12-13 12:48:58
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4楼2014-12-13 15:28:19