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micro-chh铜虫 (初入文坛)
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[求助]
关于系统发育树可信度的问题 已有1人参与
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| 生物信息学里有讲系统发育树的构建，各位大神了解不？发育树节点处的数字代表可信度，越大越好！我做的发育树可信度好低，，，小伙伴们知道是什么原因不？如何提高？谢谢，，，， |
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micro-chh3楼2014-12-25 16:42:56
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
micro-chh: 金币+5, ★有帮助 2014-12-26 10:45:58
micro-chh: 金币+5, ★有帮助 2014-12-26 10:45:58
| 系统发育树上的数字代表可信度，和在Blast时的序列相似度是不同的，我在建树时也遇到了这个问题，命名序列的相似度很高，但系统发育树上面的可信度却很低，这是因为这两个完全是两回事。我也还在建树的摸索阶段，建树时可以选择已知的细菌序列（从参考文献中选取），文献里有很多别人建过的树，可以选择相同的序列，而且要多选一些不同的序列来进行系统树的构建。这样就可以大致知道你的序列是在哪个Cluster里面。我现在遇到的问题是需不需要对测序的结果进行OTU分类，如果你已经对建树熟练了，希望一起讨论讨论哈~ |
2楼2014-12-25 11:20:00
micro-chh
铜虫 (初入文坛)
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4楼2014-12-26 10:44:51
