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micro-chh

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于系统发育树可信度的问题 已有1人参与

生物信息学里有讲系统发育树的构建,各位大神了解不?发育树节点处的数字代表可信度,越大越好!我做的发育树可信度好低,,,小伙伴们知道是什么原因不?如何提高?谢谢,,,,
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生物大分子降解酶

我不注意发育树节点处的数字。我注意的问题是建树时候选择的序列一定要是确认序列无误的,特别是在蛋白质序列方面,一定要有论文确认该序列缺失编码一个具有该功能的蛋白质(functional characterized),不能用理论序列(putative)。在其它序列方面也是如此,有的作者自己都乱搞,用未验证的序列的,所以得到序列号之后一定要上NCBI查序列对应的reference看看是否functional characterized还是putative。如果选择putative的,就会从根本上导致建树不可信。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
3楼2014-12-25 16:42:56
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