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HSY郡主

新虫 (初入文坛)

[求助] 目的基因和表达载体连接不上,求指导!!! 已有3人参与

我的目的基因2.2k,送去公司直接合成的。合成后的目的基因连接在puc57载体上,质粒大小为4.9k,其中目的基因2.2k,puc57载体本身2.7k。以质粒为模板进行pcr,胶回收目的片段,然后双酶切(bamh1和ecor1)目的片段和表达载体pyes2(5.9k),连接,转化。平板顺利长菌了,菌落pcr结果为阳性,提质粒酶切以后,却惊奇的发现两条带的大小约为2.2k和2.7k!!!!质粒竟然是最初的“目的基因+puc57载体”,而不是自己想要的“目的基因+pyes2载体”!!!全是假阳性,没有我想要构建的质粒,why?!!!
       我明明已经切胶回收了,按说不应该污染这么多当时pcr做模板的质粒啊,新手上路,求大家指导!
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HSY郡主

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 去哪里看海 at 2014-12-08 17:23:54
还是觉得不应该有Puc57质粒,所以啊,你的酶切结果也有可能不是他们俩,就是凑巧,看看这两个酶切位点是不是只有一个
如果觉得链接体系有问题的话,可以多做几种,用不同的比例,1:4 2:3 都可以试试...

请教了一下师兄,找到问题所在了。是pcr产物里面污染了质粒,我这次提的Puc57质粒,有好几条带(6-7条),其中最下面的淡淡的那条带跟pcr产物带几乎在一个位置。赤裸裸的污染啊!!!也就是说我的目的片段跟pyes2根本没连上,改变一下连接体系再试试吧,不知道能不能做出来
5楼2014-12-08 19:02:09
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去哪里看海

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看你的表述应该是没有问题的,既然现在出问题了,就一项一项的排除。如果都这么做下来的话,出现了puc57质粒就不应该,因为根本就没有他的事,P完目的条带就用不上了啊。
首先,合成的片段有没有问题,跟NCBI对比一下;PCR获得的目的片段大小正确?回收做的有无问题?酶切一定切好了吗??质粒的酶切有两条带是不是?
2楼2014-12-08 14:48:56
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HSY郡主

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 去哪里看海 at 2014-12-08 14:48:56
看你的表述应该是没有问题的,既然现在出问题了,就一项一项的排除。如果都这么做下来的话,出现了puc57质粒就不应该,因为根本就没有他的事,P完目的条带就用不上了啊。
首先,合成的片段有没有问题,跟NCBI对比一 ...

我在想是不是连接体系有问题?尝试一下把连接体系里面的基因片段少加一些试试。真心想不到哪里还有问题
3楼2014-12-08 15:31:46
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去哪里看海

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by HSY郡主 at 2014-12-08 15:31:46
我在想是不是连接体系有问题?尝试一下把连接体系里面的基因片段少加一些试试。真心想不到哪里还有问题...

还是觉得不应该有Puc57质粒,所以啊,你的酶切结果也有可能不是他们俩,就是凑巧,看看这两个酶切位点是不是只有一个
如果觉得链接体系有问题的话,可以多做几种,用不同的比例,1:4 2:3 都可以试试
4楼2014-12-08 17:23:54
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