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fengliu

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 有关相互作用能的计算

我想请教一下,我用lammps计算两种分子间的相互作用能,即分子A和B间的相互作用能,且分子A和分子B的相互作用采用L-J势函数,计算结果还可以,但对分子A改性后或者功能化后发现计算结果差不多,看文献上应该是相互作用能大很多,造成这种原因是什么?各位用什么方法来计算相互作用能的?谢谢。

[ Last edited by 月只蓝 on 2014-12-10 at 08:33 ]
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ysshj

金虫 (小有名气)

同问。
计算结果还可以、差不多是指什么结果?莫非是总势能?
我感觉通过dump和rerun可以算某一部分的能量。
一个人要像一支队伍。
4楼2014-12-09 18:29:02
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mirmir

新虫 (小有名气)

力场是一样的吗?
2楼2014-12-05 19:10:46
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fengliu

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mirmir at 2014-12-05 19:10:46
力场是一样的吗?

力场是一样的。你算过相互作用能?你是怎么算的?谢谢。
3楼2014-12-06 08:50:00
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