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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 扩散能垒的MS计算步骤？？
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故事是这样的

新虫 (小有名气)

[求助] 扩散能垒的MS计算步骤？？ 已有1人参与

1，想通过MS计算气体在分子筛里面的扩散能垒（如正己烷在LTA里面扩散），查阅资料得知是先建立扩散路径然后设定步长，之后再优化机构得到能量。但是本人初入MS不知道具体的步骤？求各路大侠耐心指教一下~~~
2，“正己烷在LTA里面扩散”以及“Ne在LTA里面扩散”用Forcite模块计算扩散系数时，两个体系summation method都是选择“E:ewald vdh:atom..”？
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1楼 2014-12-01 17:16:27
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★
月只蓝: 应助指数+1 2014-12-02 09:15:55
故事是这样的(月只蓝代发): 金币+3, 感谢指导！ 2014-12-02 09:16:04
http://muchong.com/html/201003/1865696.html
你看看这个帖子有没有参考意义
扩散能垒我没做过
能垒的话，是不是像化学反应一样，要找到一个中间态（过渡态）？
赞一下(1人) 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-12-02 08:56:11
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普通回帖

故事是这样的

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-12-02 08:56:11
http://muchong.com/html/201003/1865696.html
你看看这个帖子有没有参考意义
扩散能垒我没做过
能垒的话，是不是像化学反应一样，要找到一个中间态（过渡态）？

恩 谢谢大神~~
我之前也看到了这个帖子，但是不明白里面一句话：“自己设计原子的扩散路径，通过计算在这个路径上的不同点的能量，可以得到扩散能垒”，如何设定扩散路径呀？
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3楼2014-12-02 09:01:58
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
3楼: Originally posted by 故事是这样的 at 2014-12-02 09:01:58
恩 谢谢大神~~
我之前也看到了这个帖子，但是不明白里面一句话：“自己设计原子的扩散路径，通过计算在这个路径上的不同点的能量，可以得到扩散能垒”，如何设定扩散路径呀？...

这个我也不太清楚 没看过相关文献
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2014-12-02 09:13:47
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故事是这样的

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2014-12-02 09:13:47
这个我也不太清楚 没看过相关文献...

哦~~还是非常感谢您的  之前您也帮我解决了好多问题~~谢谢
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5楼2014-12-02 09:21:56
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故事是这样的

新虫 (小有名气)
各路大神~~请赐教啊~~~~
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6楼2014-12-02 09:23:07
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
故事是这样的: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-12-02 13:17:58
abinitio: 金币+2, 应助指数+1, 感谢应助 2014-12-02 17:02:11
引用回帖:
6楼: Originally posted by 故事是这样的 at 2014-12-02 09:23:07
各路大神~~请赐教啊~~~~

扩散能垒的大多数文章都是原子在金属扩散，找路径
小分子的不多

找了一篇文献给你，不是路径计算的
H2在MOF中扩散
扩散能垒的MS计算步骤？？
这个是扩散系数Df与扩散激活能Ea的关系式
文章还假设Ea与密度D线性相关
拟合扩散系数Df与密度D的曲线求出Ea

这个过程的合理性你自己判断下
你看看分子模拟方面能不能用这个思路做，我没仔细看

查英文文献的话，是这么几个关键词
diffusion activation energy ， barrier ， 加个“MOF”关键词应该能过滤掉很多原子扩散的文献
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  • 附件 1 : HydrogenpermeationanddiffusionindensifiedMOF-5pellets.pdf
    • 2014-12-02 10:34:28, 995.66 K
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
7楼2014-12-02 10:41:10
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故事是这样的

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by pigrass at 2014-12-02 10:41:10
扩散能垒的大多数文章都是原子在金属扩散，找路径
小分子的不多

找了一篇文献给你，不是路径计算的
H2在MOF中扩散

这个是扩散系数Df与扩散激活能Ea的关系式
文章还假设Ea与密度D线性相关
拟合扩散系数Df ...

好的非常感谢~~
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8楼2014-12-02 13:18:03
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故事是这样的

新虫 (小有名气)
想得到类似的路径与能量的图形~~
扩散能垒的MS计算步骤？？-1
路径能量.jpg
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9楼2014-12-02 13:28:07
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故事是这样的

新虫 (小有名气)
追加悬赏~~自顶~~~
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10楼2014-12-03 19:41:42
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