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踏雪无极限

新虫 (初入文坛)

[求助] RT-PCR相关问题,新手遇到一些问题,比较纠结,前来求教? 已有2人参与

最近刚刚开始做PCR,遇到一个问题,同一个基因,取虫子的六个不同组织的cDNA模板,设计了三对不同的引物,其中两对扩增结果是一样的,见图1,2,另一对引物比较特别,六个组织中基因表达量一点差异都没有,见图3(图1,2,3都是30个循环下,退火温度50度),对于第三对引物我又试了降低循环数(25c,27c),提高退火温度(55,63度),还是没差异,
所以觉得很奇怪,即便actin也达不到如此一致,而且第三对引物扩出来的就是目的片段,做其它实验时顺便回收测了序,没有问题,
那么三对引物不一样,到底以哪个为准呢?

RT-PCR相关问题,新手遇到一些问题,比较纠结,前来求教?
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RT-PCR相关问题,新手遇到一些问题,比较纠结,前来求教?-1
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RT-PCR相关问题,新手遇到一些问题,比较纠结,前来求教?-2
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ixiaoye2012

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
踏雪无极限(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-11-24 19:07:25
为何不做RT-PCR,你这个只能看到最后的结果,看不到过程是怎么样的。
就算大雨将整座城市颠倒,我也会给你拥抱
2楼2014-11-24 15:16:55
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陆朝军

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你的目的基因是单拷贝吗?也许第三对引物有扩到其他的拷贝上!
3楼2015-01-26 21:47:11
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