应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » MD分子动力学NVT系综模拟时间选择
51/1返回列表
查看: 1535  |  回复: 4
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

michal_li

新虫 (小有名气)

[求助] MD分子动力学NVT系综模拟时间选择已有4人参与

请教大家，NVT模拟时候，模拟时间及步长怎么选择的，依据是什么？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2014-11-06 10:19:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
多看看基础的书籍或者软件操作之类的，相信这个问题你很快会解决的。
赞一下 回复此楼
逆风奔跑。
5楼2014-11-07 15:49:05
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
推荐一本书看看吧，陈正隆：分子的模拟理论与实践
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-11-06 10:22:02
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
模拟时间要以最终系统稳定为准，比如温度、能量的波动值趋于平稳。
时间步长的选择默认是1fs，可以根据自己需要选择，但最好不要超过5fs，这样会影响计算精度，导致能量与温度波动较大。
理论上说可以小点，但会极大增加计算工作量。
赞一下 回复此楼
3楼2014-11-06 14:39:25
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ChemiAndy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼上说得是预平衡的时间。平衡之后要采样。那么问题来了，采样要跑多久？
请看：分子模拟时间越长越好吗？http://muchong.com/html/201106/3352981.html
赞一下 回复此楼
4楼2014-11-07 10:59:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭