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hf8450

铁虫 (小有名气)

[交流] 为什么用MD做不出囊泡的结构

最近本学末想用MD做一下经典的囊泡结构,从最初的无规分散的 小脂质体做起,调了一个月参数做也做不出来。看过Markvoort的文献,他们用DPPC先做双分子膜,在做囊泡、就想问下用一般的自组装做不出囊泡吗?
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sciencejoy

新虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
理论上是可以,但会卡在亚稳态上,所以,初始结构要接近最后的自组装结构,计算会提高效率
5楼2014-11-04 21:33:00
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kindermoon

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用bilayer然后self-assembly就可以了,就是要用一个比membrane 尺寸大一点的盒子,盒子边缘用水填充,直接跑大概几百纳米就可以形成囊泡了。最好用coarse-grained做,比较快一点
6楼2014-11-04 22:08:35
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