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大爷给跪了

新虫 (小有名气)

[求助] 本地化blast注释后,想从结果中的Subject Seq-id得到Nr-annotation,求大神指导。 已有1人参与

如题,现在注释结果已经出来,其中Subject Seq-id(也就是比对到的nr数据库中的gi)放进一个txt文件中,如图1。
这时候,我想根据这个txt,把nr数据库(如图2)中,这些gi所代表的基因的名称一起找出来,一对一输入一个excel中。
如图2中gi|67472372|sp|P0A7T7.2|RS18_ECOLI是nr水库中的,它在txt中,想找出它后的RecName: Full=30S ribosomal protein S18 [Escherichia coli K-12](对这个基因的说明和名字)。

本地化blast注释后,想从结果中的Subject Seq-id得到Nr-annotation,求大神指导。
图1.jpg


本地化blast注释后,想从结果中的Subject Seq-id得到Nr-annotation,求大神指导。-1
图2.jpg
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大爷给跪了

新虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by 大爷给跪了 at 2014-10-21 22:27:43
用notepad打开的,看的时候有个分隔符,如三所示,是大写的SHO.
而且,同一个gi,从图中第二个>gi看得出来,可能有多个名字,不同的名字用“;”分开.
哎,反正复杂的东东

3.jpg
...

我用服务器跑的,还是很慢啊
18楼2014-10-21 22:57:41
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