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honeywanghe

铁虫 (初入文坛)

[求助] 纯化后蛋白中DNA污染检测已有3人参与

求教下有什么方法可以检测纯化后的蛋白中是否含有DNA污染、污染程度如何呀?
求大神指点!谢谢啦!
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
honeywanghe: 金币+4, 有帮助 2014-10-17 12:55:54
引用回帖:
4楼: Originally posted by honeywanghe at 2014-10-16 13:54:56
谢谢  我做的是蛋白酶  需要检验纯化后的蛋白酶是否有DNA污染  因为纯化过程中已经尽量减少DNA的存在了  现在的目的就是要在不影响酶活的前提下验证是否成功  是否DNA污染足够小以致可以忽略其对酶活性的影响。 不 ...

我这里假设你用大肠杆菌作为宿主菌表达你的目的蛋白,那么纯化中最大的污染源就是大肠杆菌的基因组DNA和质粒DNA
所以选一个大肠杆菌的保守基因,做一个荧光定量,可以定量得出你的蛋白核酸含量。
然后这个浓度足够低的情况下,应该可以排除核酸对你的蛋白活性的影响。
行至水穷处,坐看云起时
6楼2014-10-16 22:58:22
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人意见,选一个宿主菌或细胞的保守基因,然后上荧光定量,如果低于某个数值,就可以认为没有了吧?
行至水穷处,坐看云起时
2楼2014-10-15 17:24:11
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毛毛虫123321

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
honeywanghe(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-10-16 14:57:39
紫外分光光度计测A260 和A280  一般 A280/A260在1.5-2.0之间 蛋白纯度较高 基本无核酸
3楼2014-10-16 10:55:42
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honeywanghe

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pennchem at 2014-10-15 17:24:11
个人意见,选一个宿主菌或细胞的保守基因,然后上荧光定量,如果低于某个数值,就可以认为没有了吧?

谢谢  我做的是蛋白酶  需要检验纯化后的蛋白酶是否有DNA污染  因为纯化过程中已经尽量减少DNA的存在了  现在的目的就是要在不影响酶活的前提下验证是否成功  是否DNA污染足够小以致可以忽略其对酶活性的影响。 不知可有什么好的建议  期待您的解答!
4楼2014-10-16 13:54:56
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