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95846713

新虫 (初入文坛)

[求助] PMD18-T 双酶切 多克隆位点问题 已有1人参与

本人新手,想问问目的基因连接已经设计好酶切位点的引物后,打算双酶切 引物设计的酶切位点是 Ecor i和Bamh i 但是我发现连接的 PMD18-T多克隆位点上也有这两个酶切位点,那么我双酶切时怎么才能知道切下来的是多克隆位点的Ecor i和Bamh i 还是目的片段上的Ecor i和Bamh i ? 怎样才能确保双酶切时切下来的是目的片段上的Ecor i和Bamh i 呢 ?
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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95846713(西门吹雪170代发): 金币+4, 鼓励回帖交流 2014-09-19 16:34:12
95846713: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2014-09-21 16:30:56
1.选择目的片段上的一个酶切位点(非Ecor i和Bamh i )和一个载体上的酶切位点(非Ecor i和Bamh i )进行酶切,如果切的开,而且片段大小与预期一致,就可以。这是最好的。
2.PMD18-T上的Ecor i和Bamh i 之间大约是530bp左右。如果你的目的基因与这个相差很大,那么就可以直接用Ecor i和Bamh i 双酶切,看看目的片段的大小;如果相差不大,就用第1种。   这种方法只限于快速检测,有一定的不靠谱性。
3.如果你的目的基因与这个相差很大,也可以单酶切看线性片段。这时重组质粒要比载体(2700bp)大。

做克隆最终需要多种酶进行酶切鉴定的。当然了,如果测序就不用做多种了,一两种确定了就测吧,一般不会有大问题。
2楼2014-09-19 10:34:10
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