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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 怎么将pdb文件导入ms啊
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xxj9618

银虫 (初入文坛)

[求助] 怎么将pdb文件导入ms啊已有1人参与

如题，我是ms小白，我想把pdb文件导入ms中，并且想实现由一个己基取代其中的一个氢原子，用ms是否可以完成，谢谢大神们
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我有我世界。。。
1楼2014-09-11 10:03:51
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shenrongqi

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gn02530640 at 2014-09-12 15:48:16
直接把pdb文件拖曳进MS就行了...不然就File -> Import -> 右下角文件类型选择all files -> 选您修改要的pdb檔。之后将氢原子删去后手动画上己基，再选Export 转换成pdb檔就行了

pdb文件拖进MS后，无法可视化，只有一行一行的原子坐标是怎么回事？
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7楼2018-03-26 10:06:40
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gn02530640

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xxj9618: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2014-09-17 09:59:32
直接把pdb文件拖曳进MS就行了...不然就File -> Import -> 右下角文件类型选择all files -> 选您修改要的pdb檔。之后将氢原子删去后手动画上己基，再选Export 转换成pdb檔就行了
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2楼2014-09-12 15:48:16
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xxj9618

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gn02530640 at 2014-09-12 15:48:16
直接把pdb文件拖曳进MS就行了...不然就File -> Import -> 右下角文件类型选择all files -> 选您修改要的pdb檔。之后将氢原子删去后手动画上己基，再选Export 转换成pdb檔就行了

那这个结构最优化怎么做
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我有我世界。。。
3楼2014-09-16 09:12:42
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gn02530640

银虫 (小有名气)
Forcite Tools -> Calculation -> 在 Setup 栏的 Task 栏选 Geometry Optimazation，在 Energy 栏的 Forcefield 栏选择对应的分子力场，不是特殊分子的话一般选 Universal 就行。接着点 Run。

建议可以先看一下中文教程。
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    • 2014-09-17 15:56:33, 4.19 M
4楼2014-09-17 15:57:22
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