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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 一个四原子自由基COONa怎么也优化不出来了！！！！！
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zhou2009

版主 (著名写手)
我觉得这个体系在电子结构上比较特殊，需要考虑电子相关。不能考虑电子相关的ub3lyp，优化时原子会四散奔逃。分子如此之小，建议用ccsd法。
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11楼2014-09-11 15:31:15
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yangmou

木虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-09-11 15:31:15
我觉得这个体系在电子结构上比较特殊，需要考虑电子相关。不能考虑电子相关的ub3lyp，优化时原子会四散奔逃。分子如此之小，建议用ccsd法。

我其他的分子都用的b3lyp，这个用ccsd做，相互比较的话有意义么，怎么解释呢，还请指教啊。
整个论文有几十个反应，审稿人让我用cbs方法做里面几个小分子的和b3lyp对比一下，我做了。就这一个两个方法都无法算。我本来也想把另外几十个原子数较多的反应一起用cbs做，但是实在算不动。
一个审稿人提了33个问题，呃呃呃呃。

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12楼2014-09-12 00:10:22
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yangmou

木虫 (小有名气)
送红花一朵
是比较不同反应路径的活化能垒和反应焓变，看哪个路径有利。

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13楼2014-09-12 00:13:08
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yangmou

木虫 (小有名气)
审稿人说他用我们用的b3lyp方法和基组找到稳定结构了，就是第二个图的结构。求救啊

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14楼2014-09-12 00:16:54
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yongleli

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by yangmou at 2014-09-11 12:05:11
不加nosymm也计算不出来呢，优化后原子都四散奔逃了，求解救啊，给出ub3lyp/6-311+g(d,p)的能量和零点能矫正值...

初始结构猜测给的对吗？目测这东西可能有conical intersection，结构不好可能优化到不对的结构。推荐扫一下势能面，C2v对称群，两个坐标：

r_Na--C

angle O--C--O
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15楼2014-09-12 07:18:13
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yongleli

木虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by yangmou at 2014-09-12 00:10:22
我其他的分子都用的b3lyp，这个用ccsd做，相互比较的话有意义么，怎么解释呢，还请指教啊。
整个论文有几十个反应，审稿人让我用cbs方法做里面几个小分子的和b3lyp对比一下，我做了。就这一个两个方法都无法算。我 ...

审稿人刁难不用愁，按照审稿人的思路全做一遍即可。
尝试跟审稿人解释是不靠谱的。生杀大权在人家手上。
关键就是你按照他的要求，还用B3LYP做出来他要的结果，
他的无理要求得到了满足，就会让你发表了。
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16楼2014-09-12 07:19:51
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yongleli

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by yangmou at 2014-09-12 00:16:54
审稿人说他用我们用的b3lyp方法和基组找到稳定结构了，就是第二个图的结构。求救啊

祝好运
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17楼2014-09-12 07:20:29
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yangmou

木虫 (小有名气)
报告大家最后的结果，最终通过opt=Cartesian这个关键词优化出结构来了，具体道理我也不懂，盼高手在版上解释一下，给我们普及普及知识。
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18楼2014-09-12 18:48:07
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