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wangqin51919

木虫 (正式写手)

努力的人

[求助] 求助电极表面修饰DNA单链之后链与链之间的距离问题。 已有1人参与

我想请问一下,在金电极表面修饰上DNA单链后,相邻DNA链之间的距离是几个纳米呢?查阅文献没有找到。不甚感激。
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种事太难说了,首先你的金电极几乎可以打包票说不会是分子级平滑的,你看着平滑的电极表面对于DNA分子来说就是一大片有高山有深谷的复杂地形。所以DNA分子在电极表面的固定肯定是不均匀的,有的地方相对密集一些,有的地方相对稀疏一些。我估计实验条件对于DNA在金电极表面的分布的影响这件事本身就可以做一个大研究。
2楼2014-09-02 15:49:43
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wangqin51919

木虫 (正式写手)

努力的人

引用回帖:
2楼: Originally posted by greeneese at 2014-09-02 15:49:43
这种事太难说了,首先你的金电极几乎可以打包票说不会是分子级平滑的,你看着平滑的电极表面对于DNA分子来说就是一大片有高山有深谷的复杂地形。所以DNA分子在电极表面的固定肯定是不均匀的,有的地方相对密集一些, ...

非常感谢你的回答,我想再问一下,如果是在纳米金颗粒表面结合DNA,那相邻之间的DNA距离可以计算么?大概有几个纳米呢?
只要明天还在,就不悲伤,不气馁!
3楼2014-09-02 18:22:46
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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wangqin51919: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 很感谢你的应助。 2014-09-03 15:35:43
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangqin51919 at 2014-09-02 18:22:46
非常感谢你的回答,我想再问一下,如果是在纳米金颗粒表面结合DNA,那相邻之间的DNA距离可以计算么?大概有几个纳米呢?...

这个好办点,纳米金只要制备的时候技术过关就能做的很接近球体,表面可以认为是原子级平滑的,然后你用激光粒度计配合电镜测一下平均直径,代入球体表面积公式 估算出平均表面积;代入球体体积公式乘上金的密度,计算出单个纳米金的质量;根据你制备纳米金的时候投入的氯金酸的量计算出进入纳米金的金元素总量,然后计算出纳米金的颗粒个数,再计算其总表面积。然后用紫外或荧光信号差减法测定单位体积纳米金悬浮液结合的DNA的数目;然后可以计算出单位面积上结合了多少个DNA分子,再假设这些分子都是均匀结合在纳米金表面上的,就可以估算出DNA分子间的平均距离了。
4楼2014-09-03 11:01:48
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wangqin51919

木虫 (正式写手)

努力的人

引用回帖:
4楼: Originally posted by greeneese at 2014-09-03 11:01:48
这个好办点,纳米金只要制备的时候技术过关就能做的很接近球体,表面可以认为是原子级平滑的,然后你用激光粒度计配合电镜测一下平均直径,代入球体表面积公式 {S=pi*D^2}估算出平均表面积;代入球体体积公式乘上金 ...

非常感谢你的专业解答。那你了解到目前有人去估算过DNA分子间的平均距离吗?我主要是想知道它们之间的大概距离,在设计实验方案的时候需要考虑,我查了很久的文献都没用找到。
只要明天还在,就不悲伤,不气馁!
5楼2014-09-03 15:39:08
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greeneese

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wangqin51919 at 2014-09-03 15:39:08
非常感谢你的专业解答。那你了解到目前有人去估算过DNA分子间的平均距离吗?我主要是想知道它们之间的大概距离,在设计实验方案的时候需要考虑,我查了很久的文献都没用找到。...

我查一下,不过首先可以给你个提示,Chad A. Mirkin是个研究纳米金表面DNA结合问题的大牛。
6楼2014-09-04 08:50:52
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wangqin51919

木虫 (正式写手)

努力的人

引用回帖:
6楼: Originally posted by greeneese at 2014-09-04 08:50:52
我查一下,不过首先可以给你个提示,Chad A. Mirkin是个研究纳米金表面DNA结合问题的大牛。...

嗯嗯,谢谢你。我去查一下,他做的文章。
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7楼2014-09-04 09:24:03
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邪恶的大肉丸

金虫 (著名写手)

如果实际操作的话,可以用TEM观察到的。论坛里有其他虫友做了前期工作,可以参考一下她的TEM。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7771663&fpage=1&target=blank
8楼2014-09-05 15:33:16
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