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andyzhengwp

金虫 (小有名气)

[求助] 关于in-fusion PCR问题已有4人参与

我现在要将一个片段无缝的插入到一个质粒的特定位点中,Clontech的In-Fusion试剂盒已经买了,但是发现它需要将质粒线性化,如果酶切线性化的话将不是无缝连接,会有几个碱基多出来,质粒有太大无法pcr方法线性化。
求助:1,有没有好的方法师质粒不加碱基线性化(酶切之后再PCR,肯定会在以前质粒的基础上多出几个碱基来的)?
         2.或者有什么好的方法直接实现将一个片段无缝的插入到一个质粒的特定位点中?
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ksws0465326

金虫 (小有名气)

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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-08-21 15:32:27
引用回帖:
18楼: Originally posted by andyzhengwp at 2014-08-21 10:21:49
我用的您推荐的条件,primerSTAR MAX,50ul体系,50度退火,68度延伸7min,质粒没有做过单酶切。...

最好还是单酶切鉴定下,这个质粒到底是不是你要用的。。如果模板本身不对,做什么都没用了不是,呵呵,毕竟MAX不便宜阿,再有,50度退火你做了5s?还是别的?如果是5s,再做个15s试试,或是,用那个体系,作个模板浓度梯度。。。这样高效率的酶,对模板量要求还是比较高的,你买的说明书是中文的还是英文的?里边应该有他们做的各种条件下实验数据吧(基因组,质粒,cDNA,rDNA用量,时间什么的)如果没有再给你份说明书
19楼2014-08-21 14:24:36
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bio_sci

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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-19 12:46:28
andyzhengwp: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-08-19 14:56:28
酶切线性化,然后用Klenow酶大片段 补平,不过引物设计的时候得注意了
2楼2014-08-19 12:40:35
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ksws0465326

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
andyzhengwp: 金币+5 2014-08-19 14:56:35
andyzhengwp: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-08-19 14:56:46
不知道你用的质粒到底多大,我前些时曾经扩增4k+的线性质粒,用的primerstar GXL,效果很好,而且用这个扩增,线性DNA末尾不会像Taq那样多出一个A碱基。如果可以的话你可以拿这个试一试扩增你的质粒。
3楼2014-08-19 13:32:12
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andyzhengwp

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ksws0465326 at 2014-08-19 13:32:12
不知道你用的质粒到底多大,我前些时曾经扩增4k+的线性质粒,用的primerstar GXL,效果很好,而且用这个扩增,线性DNA末尾不会像Taq那样多出一个A碱基。如果可以的话你可以拿这个试一试扩增你的质粒。

我的质粒有7k多,我用的primerstar MAX酶,结果没有扩出来
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4楼2014-08-19 14:52:12
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