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大仲的马

木虫 (小有名气)

[求助] lammps蒸发fix evaporate问题

利用lammps中fix evaporate研究水分子的蒸发,
fix        2  all evaporate   1000 3  high  38277 molecule yes
按lammps手册所说,当molecule为yes时,删除一个原子时会将所属分子中的原子全删掉,但我运行时却总是出错,并提示
Step: 34 -> Deletion postion: 2.2297e+00, 1.2760e+01, 4.0117e+01
ERROR on proc 0: Bond atoms 598 600 missing on proc 0 at step 34

求大神帮助
附上in和data文件
units                real
atom_style        full
boundary        p p ff
lattice sc 1.0

pair_style        lj/cut/coul/cut 9.0 9.0

bond_style      harmonic

angle_style     harmonic

read_data        water.data

region    high   block EDGE EDGE EDGE EDGE 40 EDGE


neighbor        2.0 bin
neigh_modify        delay 5

timestep        1.0

thermo_style        multi
thermo                1000

fix                1 all nvt temp 400.0 400.0 100

fix  zwall   all wall/lj93 zlo EDGE 0.3696 3.165541 8.0 zhi EDGE 0.3696 3.165541 2.3

dump                1 all custom 1 dump.all id mol type q x y z

fix        2  all evaporate   1000 3  high  38277 molecule yes
run             1000
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  • 附件 1 : water.data
  • 2014-08-16 22:33:59, 64.15 K

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不忘记怀念,不停止向前
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qcliu

金虫 (小有名气)

楼主的问题解决了么?我也遇到了同样的问题。
2楼2015-05-15 03:41:15
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大仲的马

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qcliu at 2015-05-15 03:41:15
楼主的问题解决了么?我也遇到了同样的问题。

我换了个版本,就没有这问题了
不忘记怀念,不停止向前
3楼2015-05-15 08:54:24
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