应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 大家看这对甲基化BSP引物设计有什么问题？
41/1返回列表
查看: 2385  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yinyongtai

新虫 (初入文坛)

[交流] 大家看这对甲基化BSP引物设计有什么问题？ 已有2人参与

本人刚刚接触甲基化测序，
有一启动子，想检测甲基化水平，设计BSP引物时碰了钉子，参考了别人的文献发现BSP引物序列如下：
上游：
ATATTTTATTAAGTTGGGGGAATTG
下游：
ACCCTCAAAAAATCACTAAAAAAAC

按照我的理解，亚硫酸盐处理后的DNA中非甲基化的C碱基会变成T；引物应该都要避免与C碱基配对才对，
那么，请问，上述引物为什么上游有那么多G呢？？？



新手上路，多多指教！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

表观遗传

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-08-07 21:01:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robustniquew

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-08-08 13:51:19
能否提供一下相应的序列？BSP引物一般都是在CpG岛两端设计的引物，但是也不是不能完全包含CG位点，如果找不到合适的设计引物的位置，在引物的5'端包含CG位点是可以的，但是3'端一定不能包含CG位点。
赞一下 回复此楼
天津强微特生物科技有限公司
2楼2014-08-08 13:11:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ADTechnology

捐助贵宾 (著名写手)

表观遗传学专业供应商
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
推荐你去看一下这个文章。
016.艾德科技教你如何在线设计甲基化的引物
链接地址：http://www.aderr.com/cn/main.php ... 23&id=24445  
赞一下 回复此楼
3楼2014-08-08 17:41:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ADTechnology

捐助贵宾 (著名写手)

表观遗传学专业供应商
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
亚硫酸盐处理后，只是将非甲基化和甲基化的C，变成U，通过PCR扩增后，非甲基化的C才变成了T，而甲基化的C，还是C。
赞一下 回复此楼
4楼2014-08-08 17:44:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yinyongtai 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭