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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 人GAPDH引物设计问题
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killion

木虫 (小有名气)

[求助] 人GAPDH引物设计问题 已有2人参与

之前都是用的现成的GAPDH引物，快用完了，所以想要自己设计一个，但是查NCBI后发现，人GAPDH的序列有4个不同的剪接体，那我应该用哪个序列进行设计呢？这是NCBI核酸库的查询结果：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore。还有个问题，为啥会有这么多的结果啊，是不是靠前的是最新的还是最可靠的啊？

人GAPDH引物设计问题
QQ截图20140805111219.jpg
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1楼 2014-08-05 11:14:59
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songzuowei

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-08-05 13:08:28
GAPDH-F        CAAGGTCATCCATGACAACTTTG
GAPDH-R        GTCCACCACCCTGTTGCTGTAG
不好使我吃了它
赞一下 回复此楼
3楼2014-08-05 12:05:49
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+3, 应助指数+1, 鼓励回帖交流！ 2014-08-05 13:08:09
都不选，选参考序列
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NG_007073.2
就是你搜索结果的第5个
一个基因可以因为rna剪切造成多个剪接体，这是结果。但是你要是测序的话，必须测全序，然后根据全序看突变，某些突变会导致发生选择性剪切。
在dna序列上，你是看不到剪接体的，只有一条含着snp的全序。只有在RNA水平上才可以看到。
他给出的剪接体是根据获得的mRNA反推回去的
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天行健
2楼2014-08-05 11:26:24
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565925427

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by songzuowei at 2014-08-05 12:05:49
GAPDH-F        CAAGGTCATCCATGACAACTTTG
GAPDH-R        GTCCACCACCCTGTTGCTGTAG
不好使我吃了它

咋吃啊？
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4楼2015-10-21 10:53:10
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songzuowei

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 565925427 at 2015-10-21 10:53:10
咋吃啊？...

要不一个碱基一个碱基的吃？
赞一下 回复此楼
5楼2015-10-21 10:59:53
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