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killion

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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专业: 神经生物学

[求助] 人GAPDH引物设计问题已有2人参与

之前都是用的现成的GAPDH引物，快用完了，所以想要自己设计一个，但是查NCBI后发现，人GAPDH的序列有4个不同的剪接体，那我应该用哪个序列进行设计呢？这是NCBI核酸库的查询结果：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore。还有个问题，为啥会有这么多的结果啊，是不是靠前的是最新的还是最可靠的啊？

QQ截图20140805111219.jpg

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1楼 2014-08-05 11:14:59

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songzuowei

木虫 (著名写手)

应助: 88 (初中生)
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专业: 生物大分子结构与功能

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-08-05 13:08:28

GAPDH-F CAAGGTCATCCATGACAACTTTG
GAPDH-R GTCCACCACCCTGTTGCTGTAG
不好使我吃了它

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3楼2014-08-05 12:05:49

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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

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【答案】应助回帖

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gyesang: 金币+3, 应助指数+1, 鼓励回帖交流！ 2014-08-05 13:08:09

都不选，选参考序列
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NG_007073.2
就是你搜索结果的第5个
一个基因可以因为rna剪切造成多个剪接体，这是结果。但是你要是测序的话，必须测全序，然后根据全序看突变，某些突变会导致发生选择性剪切。
在dna序列上，你是看不到剪接体的，只有一条含着snp的全序。只有在RNA水平上才可以看到。
他给出的剪接体是根据获得的mRNA反推回去的

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天行健