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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 算nbo时好像是chk读入错误，但是自己看不出来具体哪里的问题，求助
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谢珍妮

铜虫 (初入文坛)

[求助] 算nbo时好像是chk读入错误，但是自己看不出来具体哪里的问题，求助 已有1人参与

输入文件：
%chk=UO2LH2O3.chk
# pop=nboread b3lyp/genecp nosymm iop(5/13=1) scf=(maxcyc=120,vshift,novaracc) guess=read geom=allcheck

H C N O 0
6-31g(d)
****
U 0
S 3 1.00
12098.0820000 0.000102
1833.7573000 0.000771
351.6863200 0.002969
S 1 1.00
104.3142600 1.0
S 3 1.00
60.9058220 0.049868
35.5150860 -0.245313
20.8912270 0.723847
S 1 1.00
10.1846470 1.0
S 1 1.00
2.8518510 1.0
S 1 1.00
1.5316160 1.0
S 1 1.00
0.6162030 1.0
S 1 1.00
0.2794940 1.0
S 1 1.00
0.0572530 1.0
S 1 1.00
0.0234430 1.0
P 5 1.00
2906.8451000 0.000088
694.4005300 0.000732
224.6347900 0.003414
80.5205260 0.011099
24.0802110 0.025216
P 1 1.00
14.0775800 1.0
P 1 1.00
8.2658460 1.0
P 1 1.00
3.4236070 1.0
P 1 1.00
1.7084170 1.0
P 1 1.00
0.6550460 1.0
P 1 1.00
0.2837550 1.0
P 1 1.00
0.1018140 1.0
P 1 1.00
0.0305350 1.0
D 6 1.00
449.0195300 0.000050
156.3569500 0.000322
60.2424390 0.001777
17.7723170 0.025385
10.4543040 -0.089378
3.5834330 0.444799
D 1 1.00
1.7637240 1.0
D 1 1.00
0.7840300 1.0
D 1 1.00
0.2761270 1.0
D 1 1.00
0.0869800 1.0
F 5 1.00
105.2879300 0.000228
35.1011810 0.002308
14.5641380 0.009253
4.6518850 0.136949
2.2559730 0.339801
F 1 1.00
1.0102740 1.0
F 1 1.00
0.4116800 1.0
F 1 1.00
0.1441200 1.0
G 4 1.00
105.2879300 0.000137
35.1011810 0.001831
14.5641380 0.019940
4.6518850 0.110758
G 1 1.00
2.2559730 1.0
G 1 1.00
1.0102740 1.0
****

U 0
ECP60MWB 5 60
H-Komponente
1
2 1.00000000 0.00000000
S-H
1
2 16.41403869 536.51662778
P-H
1
2 9.06055606 169.54492465
D-H
1
2 8.83183198 142.61559837
F-H
1
2 7.01851629 60.39307602
G-H
1
2 12.80408844 -60.12998958

$nbo bndidx $end


输出文件：
%mem=20gb
%NprocShared=16
Will use up to   16 processors via shared memory.
%LindaWorker=cu83
SetLPE:  input flags=""
SetLPE:    new flags=" -nodelist 'cu83'"
Will use up to    1 processors via Linda.
%chk=UO2LH2O3.chk
Bad file opened by FileIO:  Unit=2 LstWrd=   8912896 LenFil=   8912815 NIntWP=1.
FileIO: IOper= 9 IFilNo(1)=     2 Len=           0 IPos=           0 Q=          6554520


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         40448
End          65536
End1         65536
Wr Pntr      40448
Rd Pntr      40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

我确定输入文件和读取的chk文件在同一个文件夹下
请大家帮我看看哪里有问题，也可能是一些低级错误，可是自己实在检查不出来了。。。先谢谢大家。
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1楼 2014-08-04 08:50:56
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谢珍妮

铜虫 (初入文坛)
之后我放弃读取chk，手动复制了之前优化好的分子坐标在输入文件里面，再算就没有出错了。可我还是想知道之前读入chk的时候是哪里有问题，被读取的chk是之前优化时自己生成的文件，我没有修改过，会是chk文件坏掉了吗？
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2楼2014-08-04 09:03:04
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1075460936

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
谢珍妮: 金币+3 2014-08-06 09:29:49
应该是你读取的chk文件名字与这次计算的gjf名字不一致导致的，输出部份表示你的读取出错，论坛上也有一些帖子讨论过这个问题的，你可以再搜搜看
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3楼2014-08-04 14:48:32
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谢珍妮

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 1075460936 at 2014-08-04 14:48:32
应该是你读取的chk文件名字与这次计算的gjf名字不一致导致的，输出部份表示你的读取出错，论坛上也有一些帖子讨论过这个问题的，你可以再搜搜看

读取的chk文件名是可以与gjf名不同的，我曾经这么算过，能读出来。
会不会是读取的那个chk文件太大造成的呢？68MB。以前算的都很小的说。。。。。。
论坛上的帖子也看了，，有说是输入法是中文的、有说是chk文件名不符的之类，我都检查过了，还是没找到原因T-T
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4楼2014-08-04 15:32:48
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1075460936

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 谢珍妮 at 2014-08-04 15:32:48
读取的chk文件名是可以与gjf名不同的，我曾经这么算过，能读出来。
会不会是读取的那个chk文件太大造成的呢？68MB。以前算的都很小的说。。。。。。
论坛上的帖子也看了，，有说是输入法是中文的、有说是chk文件 ...

哦，我之前遇到不一致的，就会读取不了的，修改后才行

[ 发自小木虫客户端 ]
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5楼2014-08-08 11:47:56
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就是这个FEEL

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 谢珍妮 at 2014-08-04 09:03:04
之后我放弃读取chk，手动复制了之前优化好的分子坐标在输入文件里面，再算就没有出错了。可我还是想知道之前读入chk的时候是哪里有问题，被读取的chk是之前优化时自己生成的文件，我没有修改过，会是chk文件坏掉了吗 ...

想知道怎么找优化好的分子坐标。在out文件里怎么找呢？
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6楼2016-09-13 09:13:58
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