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lmc2537

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结 已有4人参与

查了网上的相关资料,但是没有解决本人的疑惑,这里向大家求助,谢谢!

1、编码区与CDS是同一个概念吗?因为编码区包含内含子和外显子,但是cds只包含起始密码到终止密码的序列,所以应该不是同一个概念吧?

2、CDS与开放阅读框的区别?查了网上的相关资料,但是仍旧有疑问,为什么CDS可以包括很多个开放阅读框?
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petitkang

新虫 (初入文坛)

1. 基因经过转录形成Pre mRNA,这里面包含着内含子和外显子(5端是以外显子打头,但是这段外显子不仅包含CDS,还包含5' UTR;3端是以外显子结束,但是这段外显子不仅包含CDS,还包含3' UTR),经过剪接形成成熟mRNA,内含子已减掉,如果抛开后来加上去的cap和poly A的话,这时全是外显子,但是不全是CDS,因为只有中间的那部分以起始密码子开始、以终止密码子结束的片段才是CDS,只有这部分才会被翻译成蛋白质。
2. CDS是指被翻译成蛋白质的片段(故而肯定是以起始密码子开始,以终止密码子结束的片段),而ORF仅仅是指以起始密码子开始,以终止密码子结束的片段,可以说是潜在的CDS
20楼2016-03-11 15:06:08
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-31 20:10:37
1.编码区就是CDS!编码区是中文名,不含内含子,CDS是英文缩写,两者所指内容是一样的。mRNA是包含了起始密码子前和终止密码子后的序列的,估计你把编码区理解成mRNA了。
2.开放阅读框有点类似于外显子。
2楼2014-07-31 19:39:00
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lmc2537(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-01 10:32:22
1. 基因的编码区(Coding region),亦称为“编码序列”(Coding sequence)或“CDS”(Coding DNA Sequence),是指mRNA序列中编码蛋白质的那部分序列。
以上几个术语对应的是同一段序列,无论是在mRNA层面还是在含有内含子的DNA序列层面理解

2. CDS也等同于ORF(open reading frame)是编码蛋白质的序列,以ATG开始--终止密码子结束。
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2014-07-31 20:17:26
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lmc2537

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-07-31 19:39:00
1.编码区就是CDS!编码区是中文名,不含内含子,CDS是英文缩写,两者所指内容是一样的。mRNA是包含了起始密码子前和终止密码子后的序列的,估计你把编码区理解成mRNA了。
2.开放阅读框有点类似于外显子。

我的理解是基因包括编码区和非编码区,其中编码区包括内含子和外显子,也就是能够转录成hnRNA的部分,而CDS与编码区感觉不是同一个概念,编码区的概念应该比CDS更大,CDS为编码序列,即mRNA的中间部分,而编码区显然大于mRNA,所以编码区包含了编码序列。
4楼2014-07-31 22:15:22
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