24小时热门版块排行榜    

查看: 10547  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lmc2537

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结 已有4人参与

查了网上的相关资料,但是没有解决本人的疑惑,这里向大家求助,谢谢!

1、编码区与CDS是同一个概念吗?因为编码区包含内含子和外显子,但是cds只包含起始密码到终止密码的序列,所以应该不是同一个概念吧?

2、CDS与开放阅读框的区别?查了网上的相关资料,但是仍旧有疑问,为什么CDS可以包括很多个开放阅读框?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

petitkang

新虫 (初入文坛)

1. 基因经过转录形成Pre mRNA,这里面包含着内含子和外显子(5端是以外显子打头,但是这段外显子不仅包含CDS,还包含5' UTR;3端是以外显子结束,但是这段外显子不仅包含CDS,还包含3' UTR),经过剪接形成成熟mRNA,内含子已减掉,如果抛开后来加上去的cap和poly A的话,这时全是外显子,但是不全是CDS,因为只有中间的那部分以起始密码子开始、以终止密码子结束的片段才是CDS,只有这部分才会被翻译成蛋白质。
2. CDS是指被翻译成蛋白质的片段(故而肯定是以起始密码子开始,以终止密码子结束的片段),而ORF仅仅是指以起始密码子开始,以终止密码子结束的片段,可以说是潜在的CDS
20楼2016-03-11 15:06:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-31 20:10:37
1.编码区就是CDS!编码区是中文名,不含内含子,CDS是英文缩写,两者所指内容是一样的。mRNA是包含了起始密码子前和终止密码子后的序列的,估计你把编码区理解成mRNA了。
2.开放阅读框有点类似于外显子。
2楼2014-07-31 19:39:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lmc2537(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-01 10:32:22
1. 基因的编码区(Coding region),亦称为“编码序列”(Coding sequence)或“CDS”(Coding DNA Sequence),是指mRNA序列中编码蛋白质的那部分序列。
以上几个术语对应的是同一段序列,无论是在mRNA层面还是在含有内含子的DNA序列层面理解

2. CDS也等同于ORF(open reading frame)是编码蛋白质的序列,以ATG开始--终止密码子结束。
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2014-07-31 20:17:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lmc2537

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-07-31 19:39:00
1.编码区就是CDS!编码区是中文名,不含内含子,CDS是英文缩写,两者所指内容是一样的。mRNA是包含了起始密码子前和终止密码子后的序列的,估计你把编码区理解成mRNA了。
2.开放阅读框有点类似于外显子。

我的理解是基因包括编码区和非编码区,其中编码区包括内含子和外显子,也就是能够转录成hnRNA的部分,而CDS与编码区感觉不是同一个概念,编码区的概念应该比CDS更大,CDS为编码序列,即mRNA的中间部分,而编码区显然大于mRNA,所以编码区包含了编码序列。
4楼2014-07-31 22:15:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +6 雨打竹帘 2026-08-30 10/500 2026-08-31 09:29 by huixian257
[文学芳草园] 梦想 +4 myrtle 2026-08-26 4/200 2026-08-31 08:43 by 逸域隐帆
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 08:28 by xiangy672
[基金申请] 面上意见出来了 +10 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 19/950 2026-08-31 08:01 by blueearth171
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见