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天空般明朗

金虫 (小有名气)

[求助] 求助如何计算速度自相关函数。 已有2人参与

用dump得到了系统原子不同时刻的速度文件,想进一步计算其速度自相关函数,无奈编程能力弱,求助各位虫友,有没有人做过这方面的,求指导。
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人生就是不停的战斗!
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天空般明朗

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by nicoleguozi at 2014-08-12 21:46:35
分享我的几行
reset_timestep  0
compute         vacf all vacf
thermo          1
thermo_style    custom step c_vacf c_vacf c_vacf c_vacf

可以运行,在log文件中可以找到,对不对我就不知道了
但是后 ...

我的log文件总是出现 ” Invalid compute style (../modify.cpp:857),看来是LAMMPS的版本太旧?
人生就是不停的战斗!
8楼2014-08-14 15:36:15
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whl2dxl

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-07-30 16:52:02
Gromacs 中的g_velacc 是否能够满足你的需要?
The program g_velacc calculates the velocity autocorrelation function。。。。
详情请参见Gromacs说明书(manual-4.5.4是P206    8.5.4  )
2楼2014-07-27 18:21:46
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
天空般明朗: 金币+5, 有帮助 2014-07-29 23:33:15
3楼2014-07-28 01:13:20
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天空般明朗

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by whl2dxl at 2014-07-27 18:21:46
Gromacs 中的g_velacc 是否能够满足你的需要?
The program g_velacc calculates the velocity autocorrelation function。。。。
详情请参见Gromacs说明书(manual-4.5.4是P206    8.5.4  )

我用的是LAMMPS。
人生就是不停的战斗!
4楼2014-07-29 23:25:11
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