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hajierlove

铜虫 (正式写手)

[求助] 菌液pcr,坐等求助 已有7人参与

今天做的菌液pcr,三个基因挑了48个单克隆,做菌液pcr,引物是M13通用引物,出来的目的条带都是250bp。750bp。目的片段是500bp。怎么回事?只能证明没有连接上吗?
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踏实
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usky_4

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-24 09:32:44
引用回帖:
10楼: Originally posted by hajierlove at 2014-07-24 03:45:14
不是一个孔,是说,两种引物都加吗?谢谢亲的回来,非常满意
...

举例来说,pGEM-T载体的T7(上游引物)和SP6(下游引物)相隔大概有150bp,所以如果用这对引物的话,得到的产物肯定是大于你的目的基因的。
定向PCR的方法是:假设你需要你的目的基因ORF和载体是同向,那么你可以用这两种搭配 - T7+你的基因下游引物 或者 你的基因上游引物+SP6。这样一来,只有当你的基因是以和载体同向插入的时候才会有扩增产物。如果你的基因和载体反向插入,那么这两种组合等于是两个引物阅读顺序相同,所以无法扩增。这样做法的好处就是,基本保证只要能扩增出来就说明插入成功。不好之处在于,理论上筛选了一半的扩增产物,因为你其实对基因的正反向是没有要求的。只有你需要克隆表达载体的时候,才需要要求基因的ORF方向与载体方向相同。
下次再见面的时候,我们一定会笑着相遇吧
11楼2014-07-24 04:24:05
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lijianfu12

银虫 (正式写手)

你用自己的引物跑p呀!干嘛用m13

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好搞学术
2楼2014-07-23 21:26:20
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胡亚梅

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
hajierlove(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-24 09:31:32
引物特异性不行啊,建议自己根据目的条带设计会更靠谱一些
小虫虫~~
3楼2014-07-23 21:40:31
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-24 09:31:40
做阴性对照了吗?用的是什么T载体?查下通用引物之间的距离。
应该是连接转化成功了,M13通用引物扩增空载体的产物大小一般是200bp左右。这样加上你的目的片段大小应该就是对的。
4楼2014-07-23 22:23:16
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