应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp结构优化可不可以看到动画效果
313/4返回列表上一页1234下一页
查看: 4393  |  回复: 30
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2014-07-30 23:58:51
可以的，有两种方法，一是直接用VMD，而是将各原子坐标转成MS的arc文件格式，就可以用MS来看了
赞一下 回复此楼
我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
21楼2014-07-24 08:16:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
21楼: Originally posted by magicmonk at 2014-07-24 08:16:59
可以的，有两种方法，一是直接用VMD，而是将各原子坐标转成MS的arc文件格式，就可以用MS来看了

用VMD的话文件的格式不用转换吗

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字！
22楼2014-07-24 10:55:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by 黄河honour at 2014-07-24 10:55:33
用VMD的话文件的格式不用转换吗
...

不用，怎么用手册上都有
赞一下 回复此楼
我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
23楼2014-07-24 10:56:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kjsun

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖！ 2014-07-30 23:59:13
wxdragon可以实现，
不过这个不是免费软件。
赞一下 回复此楼
24楼2014-07-24 10:59:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
25楼2014-07-24 17:23:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zy54382
26楼2014-07-25 15:47:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ted1277

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2014-07-30 23:59:29
好想法，每一步的porcar都是可以用可视化软件打看看的，可以用动画制作出来。
但是，优化的位置参数变化在数量级上都是超级小的，看着是没有变动的。楼主在实现这个想法时要考虑通过某种方式把细微的变化“放大化”～
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

黄河honour
hello,boy~
27楼2014-07-26 10:17:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
27楼: Originally posted by ted1277 at 2014-07-26 10:17:38
好想法，每一步的porcar都是可以用可视化软件打看看的，可以用动画制作出来。
但是，优化的位置参数变化在数量级上都是超级小的，看着是没有变动的。楼主在实现这个想法时要考虑通过某种方式把细微的变化“放大化” ...

多谢提醒 正在尝试
赞一下 回复此楼
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字！
28楼2014-07-26 11:27:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenzidan

新虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
黄河honour(fzx2008代发): 金币+1, 谢谢回帖！ 2014-07-30 23:59:43
可以的，用vmd，vasp的每个离子步都会输出原子的位置坐标，在一个X开头的文件里面，用vmd可以直接查看
赞一下 回复此楼
29楼2014-07-27 08:03:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
29楼: Originally posted by zhenzidan at 2014-07-27 08:03:59
可以的，用vmd，vasp的每个离子步都会输出原子的位置坐标，在一个X开头的文件里面，用vmd可以直接查看

多谢

[ 发自小木虫客户端 ]
回复此楼
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字！
30楼2014-07-27 08:46:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 黄河honour 的主题更新
313/4返回列表上一页1234下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +23 医学老男孩 2026-08-13 49/2450 2026-08-14 20:02 by zhaifei
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 好奇怪的filecode +6 布布和一二 2026-08-08 7/350 2026-08-14 13:38 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭