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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖! 2014-07-30 23:58:51
可以的,有两种方法,一是直接用VMD,而是将各原子坐标转成MS的arc文件格式,就可以用MS来看了
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
21楼2014-07-24 08:16:59
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黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
21楼: Originally posted by magicmonk at 2014-07-24 08:16:59
可以的,有两种方法,一是直接用VMD,而是将各原子坐标转成MS的arc文件格式,就可以用MS来看了

用VMD的话文件的格式不用转换吗

[ 发自小木虫客户端 ]
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字!
22楼2014-07-24 10:55:33
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by 黄河honour at 2014-07-24 10:55:33
用VMD的话文件的格式不用转换吗
...

不用,怎么用手册上都有
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
23楼2014-07-24 10:56:06
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kjsun

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖! 2014-07-30 23:59:13
wxdragon可以实现,
不过这个不是免费软件。
24楼2014-07-24 10:59:53
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
25楼2014-07-24 17:23:08
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26楼2014-07-25 15:47:56
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ted1277

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖! 2014-07-30 23:59:29
好想法,每一步的porcar都是可以用可视化软件打看看的,可以用动画制作出来。
但是,优化的位置参数变化在数量级上都是超级小的,看着是没有变动的。楼主在实现这个想法时要考虑通过某种方式把细微的变化“放大化”~

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

hello,boy~
27楼2014-07-26 10:17:38
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黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
27楼: Originally posted by ted1277 at 2014-07-26 10:17:38
好想法,每一步的porcar都是可以用可视化软件打看看的,可以用动画制作出来。
但是,优化的位置参数变化在数量级上都是超级小的,看着是没有变动的。楼主在实现这个想法时要考虑通过某种方式把细微的变化“放大化” ...

多谢提醒 正在尝试
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字!
28楼2014-07-26 11:27:08
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zhenzidan

新虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
黄河honour(fzx2008代发): 金币+1, 谢谢回帖! 2014-07-30 23:59:43
可以的,用vmd,vasp的每个离子步都会输出原子的位置坐标,在一个X开头的文件里面,用vmd可以直接查看
29楼2014-07-27 08:03:59
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黄河honour

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
29楼: Originally posted by zhenzidan at 2014-07-27 08:03:59
可以的,用vmd,vasp的每个离子步都会输出原子的位置坐标,在一个X开头的文件里面,用vmd可以直接查看

多谢

[ 发自小木虫客户端 ]
不管身处哪一方土地记得在那儿树一杆大旗上面写上“艰苦奋斗”四个大字!
30楼2014-07-27 08:46:53
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