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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 帮忙分析一下这个树形图
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well_想太多

新虫 (小有名气)

[求助] 帮忙分析一下这个树形图 已有1人参与

我的目的菌株是34号,对其产的一种酶基因进行了同源性比对,找的对比菌株也是产这种酶的,但现在我不会分析34号是与3毫同源性更好,还是与5号,其中bootstrap是1000次,但是出来的值很小,不知道该怎么判断了,图片传不上来,传个附件吧,希望大神们帮一下!
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    • 2014-07-15 20:38:49, 14.81 M

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1楼 2014-07-15 20:39:52
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
well_想太多: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-07-16 14:53:47
与5号同源性高，看横线长度之和。
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2楼2014-07-16 11:25:23
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well_想太多

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-07-16 11:25:23
与5号同源性高，看横线长度之和。

请具体说说,是不是34号的长度跟5号更近所以同源性更高?12号是不是因为不是在一个分支上,所以顺序应该是5>3>12?
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3楼2014-07-16 14:53:28
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by well_想太多 at 2014-07-16 14:53:28
请具体说说,是不是34号的长度跟5号更近所以同源性更高?12号是不是因为不是在一个分支上,所以顺序应该是5>3>12?...

是这样，多序列比对后可以看到序列两两间的遗传距离矩阵表，在那个表里可以看到具体数值。
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4楼2014-07-16 16:06:32
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